1
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11
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14
15
16
17
18
19
20 rest_dict = {}
22 return {
23 'compsite' : '(?P<AanI>TTATAA)|(?P<AanI_as>TTATAA)',
24 'results' : None,
25 'site' : 'TTATAA',
26 'substrat' : 'DNA',
27 'fst3' : -3,
28 'fst5' : 3,
29 'freq' : 4096,
30 'size' : 6,
31 'opt_temp' : 37,
32 'dna' : None,
33 'inact_temp' : 65,
34 'ovhg' : 0,
35 'scd3' : None,
36 'suppl' : ('F',),
37 'scd5' : None,
38 'charac' : (3, -3, None, None, 'TTATAA'),
39 'ovhgseq' : '',
40 }
41 rest_dict['AanI'] = _temp()
42
44 return {
45 'compsite' : '(?P<AarI>CACCTGC)|(?P<AarI_as>GCAGGTG)',
46 'results' : None,
47 'site' : 'CACCTGC',
48 'substrat' : 'DNA',
49 'fst3' : 8,
50 'fst5' : 11,
51 'freq' : 16384,
52 'size' : 7,
53 'opt_temp' : 37,
54 'dna' : None,
55 'inact_temp' : 65,
56 'ovhg' : -4,
57 'scd3' : None,
58 'suppl' : ('F',),
59 'scd5' : None,
60 'charac' : (11, 8, None, None, 'CACCTGC'),
61 'ovhgseq' : 'NNNN',
62 }
63 rest_dict['AarI'] = _temp()
64
66 return {
67 'compsite' : '(?P<AasI>GAC......GTC)|(?P<AasI_as>GAC......GTC)',
68 'results' : None,
69 'site' : 'GACNNNNNNGTC',
70 'substrat' : 'DNA',
71 'fst3' : -7,
72 'fst5' : 7,
73 'freq' : 4096,
74 'size' : 12,
75 'opt_temp' : 37,
76 'dna' : None,
77 'inact_temp' : 65,
78 'ovhg' : 2,
79 'scd3' : None,
80 'suppl' : ('F',),
81 'scd5' : None,
82 'charac' : (7, -7, None, None, 'GACNNNNNNGTC'),
83 'ovhgseq' : 'NN',
84 }
85 rest_dict['AasI'] = _temp()
86
88 return {
89 'compsite' : '(?P<AatI>AGGCCT)|(?P<AatI_as>AGGCCT)',
90 'results' : None,
91 'site' : 'AGGCCT',
92 'substrat' : 'DNA',
93 'fst3' : -3,
94 'fst5' : 3,
95 'freq' : 4096,
96 'size' : 6,
97 'opt_temp' : 37,
98 'dna' : None,
99 'inact_temp' : 65,
100 'ovhg' : 0,
101 'scd3' : None,
102 'suppl' : ('O',),
103 'scd5' : None,
104 'charac' : (3, -3, None, None, 'AGGCCT'),
105 'ovhgseq' : '',
106 }
107 rest_dict['AatI'] = _temp()
108
110 return {
111 'compsite' : '(?P<AatII>GACGTC)|(?P<AatII_as>GACGTC)',
112 'results' : None,
113 'site' : 'GACGTC',
114 'substrat' : 'DNA',
115 'fst3' : -5,
116 'fst5' : 5,
117 'freq' : 4096,
118 'size' : 6,
119 'opt_temp' : 37,
120 'dna' : None,
121 'inact_temp' : 65,
122 'ovhg' : 4,
123 'scd3' : None,
124 'suppl' : ('F', 'I', 'K', 'M', 'N', 'O', 'R', 'V'),
125 'scd5' : None,
126 'charac' : (5, -5, None, None, 'GACGTC'),
127 'ovhgseq' : 'ACGT',
128 }
129 rest_dict['AatII'] = _temp()
130
132 return {
133 'compsite' : '(?P<AbsI>CCTCGAGG)|(?P<AbsI_as>CCTCGAGG)',
134 'results' : None,
135 'site' : 'CCTCGAGG',
136 'substrat' : 'DNA',
137 'fst3' : -2,
138 'fst5' : 2,
139 'freq' : 65536,
140 'size' : 8,
141 'opt_temp' : 37,
142 'dna' : None,
143 'inact_temp' : 65,
144 'ovhg' : -4,
145 'scd3' : None,
146 'suppl' : ('I',),
147 'scd5' : None,
148 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCTCGAGG'),
149 'ovhgseq' : 'TCGA',
150 }
151 rest_dict['AbsI'] = _temp()
152
154 return {
155 'compsite' : '(?P<Acc16I>TGCGCA)|(?P<Acc16I_as>TGCGCA)',
156 'results' : None,
157 'site' : 'TGCGCA',
158 'substrat' : 'DNA',
159 'fst3' : -3,
160 'fst5' : 3,
161 'freq' : 4096,
162 'size' : 6,
163 'opt_temp' : 37,
164 'dna' : None,
165 'inact_temp' : 65,
166 'ovhg' : 0,
167 'scd3' : None,
168 'suppl' : ('I', 'V'),
169 'scd5' : None,
170 'charac' : (3, -3, None, None, 'TGCGCA'),
171 'ovhgseq' : '',
172 }
173 rest_dict['Acc16I'] = _temp()
174
176 return {
177 'compsite' : '(?P<Acc36I>ACCTGC)|(?P<Acc36I_as>GCAGGT)',
178 'results' : None,
179 'site' : 'ACCTGC',
180 'substrat' : 'DNA',
181 'fst3' : 8,
182 'fst5' : 10,
183 'freq' : 4096,
184 'size' : 6,
185 'opt_temp' : 37,
186 'dna' : None,
187 'inact_temp' : 65,
188 'ovhg' : -4,
189 'scd3' : None,
190 'suppl' : ('I',),
191 'scd5' : None,
192 'charac' : (10, 8, None, None, 'ACCTGC'),
193 'ovhgseq' : 'NNNN',
194 }
195 rest_dict['Acc36I'] = _temp()
196
198 return {
199 'compsite' : '(?P<Acc65I>GGTACC)|(?P<Acc65I_as>GGTACC)',
200 'results' : None,
201 'site' : 'GGTACC',
202 'substrat' : 'DNA',
203 'fst3' : -1,
204 'fst5' : 1,
205 'freq' : 4096,
206 'size' : 6,
207 'opt_temp' : 37,
208 'dna' : None,
209 'inact_temp' : 65,
210 'ovhg' : -4,
211 'scd3' : None,
212 'suppl' : ('F', 'I', 'N', 'R', 'V', 'W'),
213 'scd5' : None,
214 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGTACC'),
215 'ovhgseq' : 'GTAC',
216 }
217 rest_dict['Acc65I'] = _temp()
218
220 return {
221 'compsite' : '(?P<AccB1I>GG[CT][AG]CC)|(?P<AccB1I_as>GG[CT][AG]CC)',
222 'results' : None,
223 'site' : 'GGYRCC',
224 'substrat' : 'DNA',
225 'fst3' : -1,
226 'fst5' : 1,
227 'freq' : 1024,
228 'size' : 6,
229 'opt_temp' : 37,
230 'dna' : None,
231 'inact_temp' : 65,
232 'ovhg' : -4,
233 'scd3' : None,
234 'suppl' : ('I', 'V'),
235 'scd5' : None,
236 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGYRCC'),
237 'ovhgseq' : 'GYRC',
238 }
239 rest_dict['AccB1I'] = _temp()
240
242 return {
243 'compsite' : '(?P<AccB7I>CCA.....TGG)|(?P<AccB7I_as>CCA.....TGG)',
244 'results' : None,
245 'site' : 'CCANNNNNTGG',
246 'substrat' : 'DNA',
247 'fst3' : -7,
248 'fst5' : 7,
249 'freq' : 4096,
250 'size' : 11,
251 'opt_temp' : 37,
252 'dna' : None,
253 'inact_temp' : 65,
254 'ovhg' : 3,
255 'scd3' : None,
256 'suppl' : ('I', 'R', 'V'),
257 'scd5' : None,
258 'charac' : (7, -7, None, None, 'CCANNNNNTGG'),
259 'ovhgseq' : 'NNN',
260 }
261 rest_dict['AccB7I'] = _temp()
262
264 return {
265 'compsite' : '(?P<AccBSI>CCGCTC)|(?P<AccBSI_as>GAGCGG)',
266 'results' : None,
267 'site' : 'CCGCTC',
268 'substrat' : 'DNA',
269 'fst3' : -3,
270 'fst5' : 3,
271 'freq' : 4096,
272 'size' : 6,
273 'opt_temp' : 37,
274 'dna' : None,
275 'inact_temp' : 65,
276 'ovhg' : 0,
277 'scd3' : None,
278 'suppl' : ('I', 'V'),
279 'scd5' : None,
280 'charac' : (3, -3, None, None, 'CCGCTC'),
281 'ovhgseq' : '',
282 }
283 rest_dict['AccBSI'] = _temp()
284
286 return {
287 'compsite' : '(?P<AccI>GT[AC][GT]AC)|(?P<AccI_as>GT[AC][GT]AC)',
288 'results' : None,
289 'site' : 'GTMKAC',
290 'substrat' : 'DNA',
291 'fst3' : -2,
292 'fst5' : 2,
293 'freq' : 1024,
294 'size' : 6,
295 'opt_temp' : 37,
296 'dna' : None,
297 'inact_temp' : 65,
298 'ovhg' : -2,
299 'scd3' : None,
300 'suppl' : ('B', 'J', 'K', 'M', 'N', 'O', 'R', 'S', 'U', 'W', 'X'),
301 'scd5' : None,
302 'charac' : (2, -2, None, None, 'GTMKAC'),
303 'ovhgseq' : 'MK',
304 }
305 rest_dict['AccI'] = _temp()
306
308 return {
309 'compsite' : '(?P<AccII>CGCG)|(?P<AccII_as>CGCG)',
310 'results' : None,
311 'site' : 'CGCG',
312 'substrat' : 'DNA',
313 'fst3' : -2,
314 'fst5' : 2,
315 'freq' : 256,
316 'size' : 4,
317 'opt_temp' : 37,
318 'dna' : None,
319 'inact_temp' : 65,
320 'ovhg' : 0,
321 'scd3' : None,
322 'suppl' : ('J', 'K'),
323 'scd5' : None,
324 'charac' : (2, -2, None, None, 'CGCG'),
325 'ovhgseq' : '',
326 }
327 rest_dict['AccII'] = _temp()
328
330 return {
331 'compsite' : '(?P<AccIII>TCCGGA)|(?P<AccIII_as>TCCGGA)',
332 'results' : None,
333 'site' : 'TCCGGA',
334 'substrat' : 'DNA',
335 'fst3' : -1,
336 'fst5' : 1,
337 'freq' : 4096,
338 'size' : 6,
339 'opt_temp' : 37,
340 'dna' : None,
341 'inact_temp' : 65,
342 'ovhg' : -4,
343 'scd3' : None,
344 'suppl' : ('J', 'K', 'R', 'W'),
345 'scd5' : None,
346 'charac' : (1, -1, None, None, 'TCCGGA'),
347 'ovhgseq' : 'CCGG',
348 }
349 rest_dict['AccIII'] = _temp()
350
352 return {
353 'compsite' : '(?P<AceIII>CAGCTC)|(?P<AceIII_as>GAGCTG)',
354 'results' : None,
355 'site' : 'CAGCTC',
356 'substrat' : 'DNA',
357 'fst3' : 11,
358 'fst5' : 13,
359 'freq' : 4096,
360 'size' : 6,
361 'opt_temp' : 37,
362 'dna' : None,
363 'inact_temp' : 65,
364 'ovhg' : -4,
365 'scd3' : None,
366 'suppl' : (),
367 'scd5' : None,
368 'charac' : (13, 11, None, None, 'CAGCTC'),
369 'ovhgseq' : 'NNNN',
370 }
371 rest_dict['AceIII'] = _temp()
372
374 return {
375 'compsite' : '(?P<AciI>CCGC)|(?P<AciI_as>GCGG)',
376 'results' : None,
377 'site' : 'CCGC',
378 'substrat' : 'DNA',
379 'fst3' : -1,
380 'fst5' : 1,
381 'freq' : 256,
382 'size' : 4,
383 'opt_temp' : 37,
384 'dna' : None,
385 'inact_temp' : 65,
386 'ovhg' : -2,
387 'scd3' : None,
388 'suppl' : ('N',),
389 'scd5' : None,
390 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCGC'),
391 'ovhgseq' : 'CG',
392 }
393 rest_dict['AciI'] = _temp()
394
396 return {
397 'compsite' : '(?P<AclI>AACGTT)|(?P<AclI_as>AACGTT)',
398 'results' : None,
399 'site' : 'AACGTT',
400 'substrat' : 'DNA',
401 'fst3' : -2,
402 'fst5' : 2,
403 'freq' : 4096,
404 'size' : 6,
405 'opt_temp' : 37,
406 'dna' : None,
407 'inact_temp' : 65,
408 'ovhg' : -2,
409 'scd3' : None,
410 'suppl' : ('I', 'N', 'V'),
411 'scd5' : None,
412 'charac' : (2, -2, None, None, 'AACGTT'),
413 'ovhgseq' : 'CG',
414 }
415 rest_dict['AclI'] = _temp()
416
418 return {
419 'compsite' : '(?P<AclWI>GGATC)|(?P<AclWI_as>GATCC)',
420 'results' : None,
421 'site' : 'GGATC',
422 'substrat' : 'DNA',
423 'fst3' : 5,
424 'fst5' : 9,
425 'freq' : 1024,
426 'size' : 5,
427 'opt_temp' : 37,
428 'dna' : None,
429 'inact_temp' : 65,
430 'ovhg' : -1,
431 'scd3' : None,
432 'suppl' : ('I',),
433 'scd5' : None,
434 'charac' : (9, 5, None, None, 'GGATC'),
435 'ovhgseq' : 'N',
436 }
437 rest_dict['AclWI'] = _temp()
438
440 return {
441 'compsite' : '(?P<AcoI>[CT]GGCC[AG])|(?P<AcoI_as>[CT]GGCC[AG])',
442 'results' : None,
443 'site' : 'YGGCCR',
444 'substrat' : 'DNA',
445 'fst3' : -1,
446 'fst5' : 1,
447 'freq' : 1024,
448 'size' : 6,
449 'opt_temp' : 37,
450 'dna' : None,
451 'inact_temp' : 65,
452 'ovhg' : -4,
453 'scd3' : None,
454 'suppl' : ('I',),
455 'scd5' : None,
456 'charac' : (1, -1, None, None, 'YGGCCR'),
457 'ovhgseq' : 'GGCC',
458 }
459 rest_dict['AcoI'] = _temp()
460
462 return {
463 'compsite' : '(?P<AcsI>[AG]AATT[CT])|(?P<AcsI_as>[AG]AATT[CT])',
464 'results' : None,
465 'site' : 'RAATTY',
466 'substrat' : 'DNA',
467 'fst3' : -1,
468 'fst5' : 1,
469 'freq' : 1024,
470 'size' : 6,
471 'opt_temp' : 37,
472 'dna' : None,
473 'inact_temp' : 65,
474 'ovhg' : -4,
475 'scd3' : None,
476 'suppl' : ('I', 'V'),
477 'scd5' : None,
478 'charac' : (1, -1, None, None, 'RAATTY'),
479 'ovhgseq' : 'AATT',
480 }
481 rest_dict['AcsI'] = _temp()
482
484 return {
485 'compsite' : '(?P<AcuI>CTGAAG)|(?P<AcuI_as>CTTCAG)',
486 'results' : None,
487 'site' : 'CTGAAG',
488 'substrat' : 'DNA',
489 'fst3' : 14,
490 'fst5' : 22,
491 'freq' : 4096,
492 'size' : 6,
493 'opt_temp' : 37,
494 'dna' : None,
495 'inact_temp' : 65,
496 'ovhg' : 2,
497 'scd3' : None,
498 'suppl' : ('I', 'N'),
499 'scd5' : None,
500 'charac' : (22, 14, None, None, 'CTGAAG'),
501 'ovhgseq' : 'NN',
502 }
503 rest_dict['AcuI'] = _temp()
504
506 return {
507 'compsite' : '(?P<AcvI>CACGTG)|(?P<AcvI_as>CACGTG)',
508 'results' : None,
509 'site' : 'CACGTG',
510 'substrat' : 'DNA',
511 'fst3' : -3,
512 'fst5' : 3,
513 'freq' : 4096,
514 'size' : 6,
515 'opt_temp' : 37,
516 'dna' : None,
517 'inact_temp' : 65,
518 'ovhg' : 0,
519 'scd3' : None,
520 'suppl' : ('Q', 'X'),
521 'scd5' : None,
522 'charac' : (3, -3, None, None, 'CACGTG'),
523 'ovhgseq' : '',
524 }
525 rest_dict['AcvI'] = _temp()
526
528 return {
529 'compsite' : '(?P<AcyI>G[AG]CG[CT]C)|(?P<AcyI_as>G[AG]CG[CT]C)',
530 'results' : None,
531 'site' : 'GRCGYC',
532 'substrat' : 'DNA',
533 'fst3' : -2,
534 'fst5' : 2,
535 'freq' : 1024,
536 'size' : 6,
537 'opt_temp' : 37,
538 'dna' : None,
539 'inact_temp' : 65,
540 'ovhg' : -2,
541 'scd3' : None,
542 'suppl' : ('J', 'M'),
543 'scd5' : None,
544 'charac' : (2, -2, None, None, 'GRCGYC'),
545 'ovhgseq' : 'CG',
546 }
547 rest_dict['AcyI'] = _temp()
548
550 return {
551 'compsite' : '(?P<AdeI>CAC...GTG)|(?P<AdeI_as>CAC...GTG)',
552 'results' : None,
553 'site' : 'CACNNNGTG',
554 'substrat' : 'DNA',
555 'fst3' : -6,
556 'fst5' : 6,
557 'freq' : 4096,
558 'size' : 9,
559 'opt_temp' : 37,
560 'dna' : None,
561 'inact_temp' : 65,
562 'ovhg' : 3,
563 'scd3' : None,
564 'suppl' : ('F',),
565 'scd5' : None,
566 'charac' : (6, -6, None, None, 'CACNNNGTG'),
567 'ovhgseq' : 'NNN',
568 }
569 rest_dict['AdeI'] = _temp()
570
572 return {
573 'compsite' : '(?P<AfaI>GTAC)|(?P<AfaI_as>GTAC)',
574 'results' : None,
575 'site' : 'GTAC',
576 'substrat' : 'DNA',
577 'fst3' : -2,
578 'fst5' : 2,
579 'freq' : 256,
580 'size' : 4,
581 'opt_temp' : 37,
582 'dna' : None,
583 'inact_temp' : 65,
584 'ovhg' : 0,
585 'scd3' : None,
586 'suppl' : ('K',),
587 'scd5' : None,
588 'charac' : (2, -2, None, None, 'GTAC'),
589 'ovhgseq' : '',
590 }
591 rest_dict['AfaI'] = _temp()
592
594 return {
595 'compsite' : '(?P<AfeI>AGCGCT)|(?P<AfeI_as>AGCGCT)',
596 'results' : None,
597 'site' : 'AGCGCT',
598 'substrat' : 'DNA',
599 'fst3' : -3,
600 'fst5' : 3,
601 'freq' : 4096,
602 'size' : 6,
603 'opt_temp' : 37,
604 'dna' : None,
605 'inact_temp' : 65,
606 'ovhg' : 0,
607 'scd3' : None,
608 'suppl' : ('I', 'N'),
609 'scd5' : None,
610 'charac' : (3, -3, None, None, 'AGCGCT'),
611 'ovhgseq' : '',
612 }
613 rest_dict['AfeI'] = _temp()
614
616 return {
617 'compsite' : '(?P<AfiI>CC.......GG)|(?P<AfiI_as>CC.......GG)',
618 'results' : None,
619 'site' : 'CCNNNNNNNGG',
620 'substrat' : 'DNA',
621 'fst3' : -7,
622 'fst5' : 7,
623 'freq' : 256,
624 'size' : 11,
625 'opt_temp' : 37,
626 'dna' : None,
627 'inact_temp' : 65,
628 'ovhg' : 3,
629 'scd3' : None,
630 'suppl' : ('V',),
631 'scd5' : None,
632 'charac' : (7, -7, None, None, 'CCNNNNNNNGG'),
633 'ovhgseq' : 'NNN',
634 }
635 rest_dict['AfiI'] = _temp()
636
638 return {
639 'compsite' : '(?P<AflII>CTTAAG)|(?P<AflII_as>CTTAAG)',
640 'results' : None,
641 'site' : 'CTTAAG',
642 'substrat' : 'DNA',
643 'fst3' : -1,
644 'fst5' : 1,
645 'freq' : 4096,
646 'size' : 6,
647 'opt_temp' : 37,
648 'dna' : None,
649 'inact_temp' : 65,
650 'ovhg' : -4,
651 'scd3' : None,
652 'suppl' : ('J', 'K', 'N'),
653 'scd5' : None,
654 'charac' : (1, -1, None, None, 'CTTAAG'),
655 'ovhgseq' : 'TTAA',
656 }
657 rest_dict['AflII'] = _temp()
658
660 return {
661 'compsite' : '(?P<AflIII>AC[AG][CT]GT)|(?P<AflIII_as>AC[AG][CT]GT)',
662 'results' : None,
663 'site' : 'ACRYGT',
664 'substrat' : 'DNA',
665 'fst3' : -1,
666 'fst5' : 1,
667 'freq' : 1024,
668 'size' : 6,
669 'opt_temp' : 37,
670 'dna' : None,
671 'inact_temp' : 65,
672 'ovhg' : -4,
673 'scd3' : None,
674 'suppl' : ('M', 'N', 'W'),
675 'scd5' : None,
676 'charac' : (1, -1, None, None, 'ACRYGT'),
677 'ovhgseq' : 'CRYG',
678 }
679 rest_dict['AflIII'] = _temp()
680
682 return {
683 'compsite' : '(?P<AgeI>ACCGGT)|(?P<AgeI_as>ACCGGT)',
684 'results' : None,
685 'site' : 'ACCGGT',
686 'substrat' : 'DNA',
687 'fst3' : -1,
688 'fst5' : 1,
689 'freq' : 4096,
690 'size' : 6,
691 'opt_temp' : 37,
692 'dna' : None,
693 'inact_temp' : 65,
694 'ovhg' : -4,
695 'scd3' : None,
696 'suppl' : ('J', 'N', 'R'),
697 'scd5' : None,
698 'charac' : (1, -1, None, None, 'ACCGGT'),
699 'ovhgseq' : 'CCGG',
700 }
701 rest_dict['AgeI'] = _temp()
702
704 return {
705 'compsite' : '(?P<AgsI>TT[CG]AA)|(?P<AgsI_as>TT[CG]AA)',
706 'results' : None,
707 'site' : 'TTSAA',
708 'substrat' : 'DNA',
709 'fst3' : -3,
710 'fst5' : 3,
711 'freq' : 512,
712 'size' : 5,
713 'opt_temp' : 37,
714 'dna' : None,
715 'inact_temp' : 65,
716 'ovhg' : 1,
717 'scd3' : None,
718 'suppl' : ('I',),
719 'scd5' : None,
720 'charac' : (3, -3, None, None, 'TTSAA'),
721 'ovhgseq' : 'S',
722 }
723 rest_dict['AgsI'] = _temp()
724
726 return {
727 'compsite' : '(?P<AhaIII>TTTAAA)|(?P<AhaIII_as>TTTAAA)',
728 'results' : None,
729 'site' : 'TTTAAA',
730 'substrat' : 'DNA',
731 'fst3' : -3,
732 'fst5' : 3,
733 'freq' : 4096,
734 'size' : 6,
735 'opt_temp' : 37,
736 'dna' : None,
737 'inact_temp' : 65,
738 'ovhg' : 0,
739 'scd3' : None,
740 'suppl' : (),
741 'scd5' : None,
742 'charac' : (3, -3, None, None, 'TTTAAA'),
743 'ovhgseq' : '',
744 }
745 rest_dict['AhaIII'] = _temp()
746
748 return {
749 'compsite' : '(?P<AhdI>GAC.....GTC)|(?P<AhdI_as>GAC.....GTC)',
750 'results' : None,
751 'site' : 'GACNNNNNGTC',
752 'substrat' : 'DNA',
753 'fst3' : -6,
754 'fst5' : 6,
755 'freq' : 4096,
756 'size' : 11,
757 'opt_temp' : 37,
758 'dna' : None,
759 'inact_temp' : 65,
760 'ovhg' : 1,
761 'scd3' : None,
762 'suppl' : ('N',),
763 'scd5' : None,
764 'charac' : (6, -6, None, None, 'GACNNNNNGTC'),
765 'ovhgseq' : 'N',
766 }
767 rest_dict['AhdI'] = _temp()
768
770 return {
771 'compsite' : '(?P<AhlI>ACTAGT)|(?P<AhlI_as>ACTAGT)',
772 'results' : None,
773 'site' : 'ACTAGT',
774 'substrat' : 'DNA',
775 'fst3' : -1,
776 'fst5' : 1,
777 'freq' : 4096,
778 'size' : 6,
779 'opt_temp' : 37,
780 'dna' : None,
781 'inact_temp' : 65,
782 'ovhg' : -4,
783 'scd3' : None,
784 'suppl' : ('I', 'V'),
785 'scd5' : None,
786 'charac' : (1, -1, None, None, 'ACTAGT'),
787 'ovhgseq' : 'CTAG',
788 }
789 rest_dict['AhlI'] = _temp()
790
792 return {
793 'compsite' : '(?P<AjiI>CACGTC)|(?P<AjiI_as>GACGTG)',
794 'results' : None,
795 'site' : 'CACGTC',
796 'substrat' : 'DNA',
797 'fst3' : -3,
798 'fst5' : 3,
799 'freq' : 4096,
800 'size' : 6,
801 'opt_temp' : 37,
802 'dna' : None,
803 'inact_temp' : 65,
804 'ovhg' : 0,
805 'scd3' : None,
806 'suppl' : ('F',),
807 'scd5' : None,
808 'charac' : (3, -3, None, None, 'CACGTC'),
809 'ovhgseq' : '',
810 }
811 rest_dict['AjiI'] = _temp()
812
814 return {
815 'compsite' : '(?P<AjnI>CC[AT]GG)|(?P<AjnI_as>CC[AT]GG)',
816 'results' : None,
817 'site' : 'CCWGG',
818 'substrat' : 'DNA',
819 'fst3' : 0,
820 'fst5' : 0,
821 'freq' : 512,
822 'size' : 5,
823 'opt_temp' : 37,
824 'dna' : None,
825 'inact_temp' : 65,
826 'ovhg' : -5,
827 'scd3' : None,
828 'suppl' : ('I',),
829 'scd5' : None,
830 'charac' : (0, 0, None, None, 'CCWGG'),
831 'ovhgseq' : 'CCWGG',
832 }
833 rest_dict['AjnI'] = _temp()
834
836 return {
837 'compsite' : '(?P<AjuI>GAA.......TTGG)|(?P<AjuI_as>CCAA.......TTC)',
838 'results' : None,
839 'site' : 'GAANNNNNNNTTGG',
840 'substrat' : 'DNA',
841 'fst3' : -26,
842 'fst5' : -7,
843 'freq' : 16384,
844 'size' : 14,
845 'opt_temp' : 37,
846 'dna' : None,
847 'inact_temp' : 65,
848 'ovhg' : 5,
849 'scd3' : 6,
850 'suppl' : ('F',),
851 'scd5' : 25,
852 'charac' : (-7, -26, 25, 6, 'GAANNNNNNNTTGG'),
853 'ovhgseq' : 'NNNNN',
854 }
855 rest_dict['AjuI'] = _temp()
856
858 return {
859 'compsite' : '(?P<AleI>CAC....GTG)|(?P<AleI_as>CAC....GTG)',
860 'results' : None,
861 'site' : 'CACNNNNGTG',
862 'substrat' : 'DNA',
863 'fst3' : -5,
864 'fst5' : 5,
865 'freq' : 4096,
866 'size' : 10,
867 'opt_temp' : 37,
868 'dna' : None,
869 'inact_temp' : 65,
870 'ovhg' : 0,
871 'scd3' : None,
872 'suppl' : ('N',),
873 'scd5' : None,
874 'charac' : (5, -5, None, None, 'CACNNNNGTG'),
875 'ovhgseq' : '',
876 }
877 rest_dict['AleI'] = _temp()
878
880 return {
881 'compsite' : '(?P<AlfI>GCA......TGC)|(?P<AlfI_as>GCA......TGC)',
882 'results' : None,
883 'site' : 'GCANNNNNNTGC',
884 'substrat' : 'DNA',
885 'fst3' : -24,
886 'fst5' : -10,
887 'freq' : 4096,
888 'size' : 12,
889 'opt_temp' : 37,
890 'dna' : None,
891 'inact_temp' : 65,
892 'ovhg' : 2,
893 'scd3' : 10,
894 'suppl' : ('F',),
895 'scd5' : 24,
896 'charac' : (-10, -24, 24, 10, 'GCANNNNNNTGC'),
897 'ovhgseq' : 'NN',
898 }
899 rest_dict['AlfI'] = _temp()
900
902 return {
903 'compsite' : '(?P<AloI>GAAC......TCC)|(?P<AloI_as>GGA......GTTC)',
904 'results' : None,
905 'site' : 'GAACNNNNNNTCC',
906 'substrat' : 'DNA',
907 'fst3' : -25,
908 'fst5' : -7,
909 'freq' : 16384,
910 'size' : 13,
911 'opt_temp' : 37,
912 'dna' : None,
913 'inact_temp' : 65,
914 'ovhg' : 5,
915 'scd3' : 7,
916 'suppl' : ('F',),
917 'scd5' : 25,
918 'charac' : (-7, -25, 25, 7, 'GAACNNNNNNTCC'),
919 'ovhgseq' : 'NNNNN',
920 }
921 rest_dict['AloI'] = _temp()
922
924 return {
925 'compsite' : '(?P<AluBI>AGCT)|(?P<AluBI_as>AGCT)',
926 'results' : None,
927 'site' : 'AGCT',
928 'substrat' : 'DNA',
929 'fst3' : -2,
930 'fst5' : 2,
931 'freq' : 256,
932 'size' : 4,
933 'opt_temp' : 37,
934 'dna' : None,
935 'inact_temp' : 65,
936 'ovhg' : 0,
937 'scd3' : None,
938 'suppl' : ('I',),
939 'scd5' : None,
940 'charac' : (2, -2, None, None, 'AGCT'),
941 'ovhgseq' : '',
942 }
943 rest_dict['AluBI'] = _temp()
944
946 return {
947 'compsite' : '(?P<AluI>AGCT)|(?P<AluI_as>AGCT)',
948 'results' : None,
949 'site' : 'AGCT',
950 'substrat' : 'DNA',
951 'fst3' : -2,
952 'fst5' : 2,
953 'freq' : 256,
954 'size' : 4,
955 'opt_temp' : 37,
956 'dna' : None,
957 'inact_temp' : 65,
958 'ovhg' : 0,
959 'scd3' : None,
960 'suppl' : ('B', 'C', 'F', 'H', 'I', 'J', 'K', 'M', 'N', 'O', 'Q', 'R', 'S', 'U', 'V', 'W', 'X', 'Y'),
961 'scd5' : None,
962 'charac' : (2, -2, None, None, 'AGCT'),
963 'ovhgseq' : '',
964 }
965 rest_dict['AluI'] = _temp()
966
968 return {
969 'compsite' : '(?P<Alw21I>G[AT]GC[AT]C)|(?P<Alw21I_as>G[AT]GC[AT]C)',
970 'results' : None,
971 'site' : 'GWGCWC',
972 'substrat' : 'DNA',
973 'fst3' : -5,
974 'fst5' : 5,
975 'freq' : 1024,
976 'size' : 6,
977 'opt_temp' : 37,
978 'dna' : None,
979 'inact_temp' : 65,
980 'ovhg' : 4,
981 'scd3' : None,
982 'suppl' : ('F',),
983 'scd5' : None,
984 'charac' : (5, -5, None, None, 'GWGCWC'),
985 'ovhgseq' : 'WGCW',
986 }
987 rest_dict['Alw21I'] = _temp()
988
990 return {
991 'compsite' : '(?P<Alw26I>GTCTC)|(?P<Alw26I_as>GAGAC)',
992 'results' : None,
993 'site' : 'GTCTC',
994 'substrat' : 'DNA',
995 'fst3' : 5,
996 'fst5' : 6,
997 'freq' : 1024,
998 'size' : 5,
999 'opt_temp' : 37,
1000 'dna' : None,
1001 'inact_temp' : 65,
1002 'ovhg' : -4,
1003 'scd3' : None,
1004 'suppl' : ('F',),
1005 'scd5' : None,
1006 'charac' : (6, 5, None, None, 'GTCTC'),
1007 'ovhgseq' : 'NNNN',
1008 }
1009 rest_dict['Alw26I'] = _temp()
1010
1012 return {
1013 'compsite' : '(?P<Alw44I>GTGCAC)|(?P<Alw44I_as>GTGCAC)',
1014 'results' : None,
1015 'site' : 'GTGCAC',
1016 'substrat' : 'DNA',
1017 'fst3' : -1,
1018 'fst5' : 1,
1019 'freq' : 4096,
1020 'size' : 6,
1021 'opt_temp' : 37,
1022 'dna' : None,
1023 'inact_temp' : 65,
1024 'ovhg' : -4,
1025 'scd3' : None,
1026 'suppl' : ('F', 'J', 'O', 'R'),
1027 'scd5' : None,
1028 'charac' : (1, -1, None, None, 'GTGCAC'),
1029 'ovhgseq' : 'TGCA',
1030 }
1031 rest_dict['Alw44I'] = _temp()
1032
1034 return {
1035 'compsite' : '(?P<AlwFI>GAAA[CT].....[AG]TG)|(?P<AlwFI_as>CA[CT].....[AG]TTTC)',
1036 'results' : None,
1037 'site' : 'GAAAYNNNNNRTG',
1038 'substrat' : 'DNA',
1039 'fst3' : None,
1040 'fst5' : None,
1041 'freq' : 16384,
1042 'size' : 13,
1043 'opt_temp' : 37,
1044 'dna' : None,
1045 'inact_temp' : 65,
1046 'ovhg' : None,
1047 'scd3' : None,
1048 'suppl' : (),
1049 'scd5' : None,
1050 'charac' : (None, None, None, None, 'GAAAYNNNNNRTG'),
1051 'ovhgseq' : None,
1052 }
1053 rest_dict['AlwFI'] = _temp()
1054
1056 return {
1057 'compsite' : '(?P<AlwI>GGATC)|(?P<AlwI_as>GATCC)',
1058 'results' : None,
1059 'site' : 'GGATC',
1060 'substrat' : 'DNA',
1061 'fst3' : 5,
1062 'fst5' : 9,
1063 'freq' : 1024,
1064 'size' : 5,
1065 'opt_temp' : 37,
1066 'dna' : None,
1067 'inact_temp' : 65,
1068 'ovhg' : -1,
1069 'scd3' : None,
1070 'suppl' : ('N',),
1071 'scd5' : None,
1072 'charac' : (9, 5, None, None, 'GGATC'),
1073 'ovhgseq' : 'N',
1074 }
1075 rest_dict['AlwI'] = _temp()
1076
1078 return {
1079 'compsite' : '(?P<AlwNI>CAG...CTG)|(?P<AlwNI_as>CAG...CTG)',
1080 'results' : None,
1081 'site' : 'CAGNNNCTG',
1082 'substrat' : 'DNA',
1083 'fst3' : -6,
1084 'fst5' : 6,
1085 'freq' : 4096,
1086 'size' : 9,
1087 'opt_temp' : 37,
1088 'dna' : None,
1089 'inact_temp' : 65,
1090 'ovhg' : 3,
1091 'scd3' : None,
1092 'suppl' : ('N',),
1093 'scd5' : None,
1094 'charac' : (6, -6, None, None, 'CAGNNNCTG'),
1095 'ovhgseq' : 'NNN',
1096 }
1097 rest_dict['AlwNI'] = _temp()
1098
1100 return {
1101 'compsite' : '(?P<Ama87I>C[CT]CG[AG]G)|(?P<Ama87I_as>C[CT]CG[AG]G)',
1102 'results' : None,
1103 'site' : 'CYCGRG',
1104 'substrat' : 'DNA',
1105 'fst3' : -1,
1106 'fst5' : 1,
1107 'freq' : 1024,
1108 'size' : 6,
1109 'opt_temp' : 37,
1110 'dna' : None,
1111 'inact_temp' : 65,
1112 'ovhg' : -4,
1113 'scd3' : None,
1114 'suppl' : ('I', 'V'),
1115 'scd5' : None,
1116 'charac' : (1, -1, None, None, 'CYCGRG'),
1117 'ovhgseq' : 'YCGR',
1118 }
1119 rest_dict['Ama87I'] = _temp()
1120
1122 return {
1123 'compsite' : '(?P<Aor13HI>TCCGGA)|(?P<Aor13HI_as>TCCGGA)',
1124 'results' : None,
1125 'site' : 'TCCGGA',
1126 'substrat' : 'DNA',
1127 'fst3' : -1,
1128 'fst5' : 1,
1129 'freq' : 4096,
1130 'size' : 6,
1131 'opt_temp' : 37,
1132 'dna' : None,
1133 'inact_temp' : 65,
1134 'ovhg' : -4,
1135 'scd3' : None,
1136 'suppl' : ('K',),
1137 'scd5' : None,
1138 'charac' : (1, -1, None, None, 'TCCGGA'),
1139 'ovhgseq' : 'CCGG',
1140 }
1141 rest_dict['Aor13HI'] = _temp()
1142
1144 return {
1145 'compsite' : '(?P<Aor51HI>AGCGCT)|(?P<Aor51HI_as>AGCGCT)',
1146 'results' : None,
1147 'site' : 'AGCGCT',
1148 'substrat' : 'DNA',
1149 'fst3' : -3,
1150 'fst5' : 3,
1151 'freq' : 4096,
1152 'size' : 6,
1153 'opt_temp' : 37,
1154 'dna' : None,
1155 'inact_temp' : 65,
1156 'ovhg' : 0,
1157 'scd3' : None,
1158 'suppl' : ('K',),
1159 'scd5' : None,
1160 'charac' : (3, -3, None, None, 'AGCGCT'),
1161 'ovhgseq' : '',
1162 }
1163 rest_dict['Aor51HI'] = _temp()
1164
1166 return {
1167 'compsite' : '(?P<ApaBI>GCA.....TGC)|(?P<ApaBI_as>GCA.....TGC)',
1168 'results' : None,
1169 'site' : 'GCANNNNNTGC',
1170 'substrat' : 'DNA',
1171 'fst3' : -8,
1172 'fst5' : 8,
1173 'freq' : 4096,
1174 'size' : 11,
1175 'opt_temp' : 37,
1176 'dna' : None,
1177 'inact_temp' : 65,
1178 'ovhg' : 5,
1179 'scd3' : None,
1180 'suppl' : (),
1181 'scd5' : None,
1182 'charac' : (8, -8, None, None, 'GCANNNNNTGC'),
1183 'ovhgseq' : 'NNNNN',
1184 }
1185 rest_dict['ApaBI'] = _temp()
1186
1188 return {
1189 'compsite' : '(?P<ApaI>GGGCCC)|(?P<ApaI_as>GGGCCC)',
1190 'results' : None,
1191 'site' : 'GGGCCC',
1192 'substrat' : 'DNA',
1193 'fst3' : -5,
1194 'fst5' : 5,
1195 'freq' : 4096,
1196 'size' : 6,
1197 'opt_temp' : 37,
1198 'dna' : None,
1199 'inact_temp' : 65,
1200 'ovhg' : 4,
1201 'scd3' : None,
1202 'suppl' : ('B', 'F', 'I', 'J', 'K', 'M', 'N', 'O', 'Q', 'R', 'S', 'U', 'V', 'W', 'X'),
1203 'scd5' : None,
1204 'charac' : (5, -5, None, None, 'GGGCCC'),
1205 'ovhgseq' : 'GGCC',
1206 }
1207 rest_dict['ApaI'] = _temp()
1208
1210 return {
1211 'compsite' : '(?P<ApaLI>GTGCAC)|(?P<ApaLI_as>GTGCAC)',
1212 'results' : None,
1213 'site' : 'GTGCAC',
1214 'substrat' : 'DNA',
1215 'fst3' : -1,
1216 'fst5' : 1,
1217 'freq' : 4096,
1218 'size' : 6,
1219 'opt_temp' : 37,
1220 'dna' : None,
1221 'inact_temp' : 65,
1222 'ovhg' : -4,
1223 'scd3' : None,
1224 'suppl' : ('C', 'K', 'N', 'U'),
1225 'scd5' : None,
1226 'charac' : (1, -1, None, None, 'GTGCAC'),
1227 'ovhgseq' : 'TGCA',
1228 }
1229 rest_dict['ApaLI'] = _temp()
1230
1232 return {
1233 'compsite' : '(?P<ApeKI>GC[AT]GC)|(?P<ApeKI_as>GC[AT]GC)',
1234 'results' : None,
1235 'site' : 'GCWGC',
1236 'substrat' : 'DNA',
1237 'fst3' : -1,
1238 'fst5' : 1,
1239 'freq' : 512,
1240 'size' : 5,
1241 'opt_temp' : 37,
1242 'dna' : None,
1243 'inact_temp' : 65,
1244 'ovhg' : -3,
1245 'scd3' : None,
1246 'suppl' : ('N',),
1247 'scd5' : None,
1248 'charac' : (1, -1, None, None, 'GCWGC'),
1249 'ovhgseq' : 'CWG',
1250 }
1251 rest_dict['ApeKI'] = _temp()
1252
1254 return {
1255 'compsite' : '(?P<ApoI>[AG]AATT[CT])|(?P<ApoI_as>[AG]AATT[CT])',
1256 'results' : None,
1257 'site' : 'RAATTY',
1258 'substrat' : 'DNA',
1259 'fst3' : -1,
1260 'fst5' : 1,
1261 'freq' : 1024,
1262 'size' : 6,
1263 'opt_temp' : 37,
1264 'dna' : None,
1265 'inact_temp' : 65,
1266 'ovhg' : -4,
1267 'scd3' : None,
1268 'suppl' : ('N',),
1269 'scd5' : None,
1270 'charac' : (1, -1, None, None, 'RAATTY'),
1271 'ovhgseq' : 'AATT',
1272 }
1273 rest_dict['ApoI'] = _temp()
1274
1276 return {
1277 'compsite' : '(?P<ApyPI>ATCGAC)|(?P<ApyPI_as>GTCGAT)',
1278 'results' : None,
1279 'site' : 'ATCGAC',
1280 'substrat' : 'DNA',
1281 'fst3' : 18,
1282 'fst5' : 26,
1283 'freq' : 4096,
1284 'size' : 6,
1285 'opt_temp' : 37,
1286 'dna' : None,
1287 'inact_temp' : 65,
1288 'ovhg' : 2,
1289 'scd3' : None,
1290 'suppl' : (),
1291 'scd5' : None,
1292 'charac' : (26, 18, None, None, 'ATCGAC'),
1293 'ovhgseq' : 'NN',
1294 }
1295 rest_dict['ApyPI'] = _temp()
1296
1298 return {
1299 'compsite' : '(?P<AquII>GCCG.AC)|(?P<AquII_as>GT.CGGC)',
1300 'results' : None,
1301 'site' : 'GCCGNAC',
1302 'substrat' : 'DNA',
1303 'fst3' : 18,
1304 'fst5' : 27,
1305 'freq' : 4096,
1306 'size' : 7,
1307 'opt_temp' : 37,
1308 'dna' : None,
1309 'inact_temp' : 65,
1310 'ovhg' : 2,
1311 'scd3' : None,
1312 'suppl' : (),
1313 'scd5' : None,
1314 'charac' : (27, 18, None, None, 'GCCGNAC'),
1315 'ovhgseq' : 'NN',
1316 }
1317 rest_dict['AquII'] = _temp()
1318
1320 return {
1321 'compsite' : '(?P<AquIII>GAGGAG)|(?P<AquIII_as>CTCCTC)',
1322 'results' : None,
1323 'site' : 'GAGGAG',
1324 'substrat' : 'DNA',
1325 'fst3' : 18,
1326 'fst5' : 26,
1327 'freq' : 4096,
1328 'size' : 6,
1329 'opt_temp' : 37,
1330 'dna' : None,
1331 'inact_temp' : 65,
1332 'ovhg' : 2,
1333 'scd3' : None,
1334 'suppl' : (),
1335 'scd5' : None,
1336 'charac' : (26, 18, None, None, 'GAGGAG'),
1337 'ovhgseq' : 'NN',
1338 }
1339 rest_dict['AquIII'] = _temp()
1340
1342 return {
1343 'compsite' : '(?P<AquIV>G[AG]GGAAG)|(?P<AquIV_as>CTTCC[CT]C)',
1344 'results' : None,
1345 'site' : 'GRGGAAG',
1346 'substrat' : 'DNA',
1347 'fst3' : 17,
1348 'fst5' : 26,
1349 'freq' : 8192,
1350 'size' : 7,
1351 'opt_temp' : 37,
1352 'dna' : None,
1353 'inact_temp' : 65,
1354 'ovhg' : 2,
1355 'scd3' : None,
1356 'suppl' : (),
1357 'scd5' : None,
1358 'charac' : (26, 17, None, None, 'GRGGAAG'),
1359 'ovhgseq' : 'NN',
1360 }
1361 rest_dict['AquIV'] = _temp()
1362
1364 return {
1365 'compsite' : '(?P<ArsI>GAC......TT[CT]G)|(?P<ArsI_as>C[AG]AA......GTC)',
1366 'results' : None,
1367 'site' : 'GACNNNNNNTTYG',
1368 'substrat' : 'DNA',
1369 'fst3' : -26,
1370 'fst5' : -8,
1371 'freq' : 8192,
1372 'size' : 13,
1373 'opt_temp' : 37,
1374 'dna' : None,
1375 'inact_temp' : 65,
1376 'ovhg' : 5,
1377 'scd3' : 6,
1378 'suppl' : ('I',),
1379 'scd5' : 24,
1380 'charac' : (-8, -26, 24, 6, 'GACNNNNNNTTYG'),
1381 'ovhgseq' : 'NNNNN',
1382 }
1383 rest_dict['ArsI'] = _temp()
1384
1386 return {
1387 'compsite' : '(?P<AscI>GGCGCGCC)|(?P<AscI_as>GGCGCGCC)',
1388 'results' : None,
1389 'site' : 'GGCGCGCC',
1390 'substrat' : 'DNA',
1391 'fst3' : -2,
1392 'fst5' : 2,
1393 'freq' : 65536,
1394 'size' : 8,
1395 'opt_temp' : 37,
1396 'dna' : None,
1397 'inact_temp' : 65,
1398 'ovhg' : -4,
1399 'scd3' : None,
1400 'suppl' : ('N', 'W'),
1401 'scd5' : None,
1402 'charac' : (2, -2, None, None, 'GGCGCGCC'),
1403 'ovhgseq' : 'CGCG',
1404 }
1405 rest_dict['AscI'] = _temp()
1406
1408 return {
1409 'compsite' : '(?P<AseI>ATTAAT)|(?P<AseI_as>ATTAAT)',
1410 'results' : None,
1411 'site' : 'ATTAAT',
1412 'substrat' : 'DNA',
1413 'fst3' : -2,
1414 'fst5' : 2,
1415 'freq' : 4096,
1416 'size' : 6,
1417 'opt_temp' : 37,
1418 'dna' : None,
1419 'inact_temp' : 65,
1420 'ovhg' : -2,
1421 'scd3' : None,
1422 'suppl' : ('J', 'N', 'O'),
1423 'scd5' : None,
1424 'charac' : (2, -2, None, None, 'ATTAAT'),
1425 'ovhgseq' : 'TA',
1426 }
1427 rest_dict['AseI'] = _temp()
1428
1430 return {
1431 'compsite' : '(?P<Asi256I>GATC)|(?P<Asi256I_as>GATC)',
1432 'results' : None,
1433 'site' : 'GATC',
1434 'substrat' : 'DNA',
1435 'fst3' : -1,
1436 'fst5' : 1,
1437 'freq' : 256,
1438 'size' : 4,
1439 'opt_temp' : 37,
1440 'dna' : None,
1441 'inact_temp' : 65,
1442 'ovhg' : -2,
1443 'scd3' : None,
1444 'suppl' : (),
1445 'scd5' : None,
1446 'charac' : (1, -1, None, None, 'GATC'),
1447 'ovhgseq' : 'AT',
1448 }
1449 rest_dict['Asi256I'] = _temp()
1450
1452 return {
1453 'compsite' : '(?P<AsiGI>ACCGGT)|(?P<AsiGI_as>ACCGGT)',
1454 'results' : None,
1455 'site' : 'ACCGGT',
1456 'substrat' : 'DNA',
1457 'fst3' : -1,
1458 'fst5' : 1,
1459 'freq' : 4096,
1460 'size' : 6,
1461 'opt_temp' : 37,
1462 'dna' : None,
1463 'inact_temp' : 65,
1464 'ovhg' : -4,
1465 'scd3' : None,
1466 'suppl' : ('I', 'V'),
1467 'scd5' : None,
1468 'charac' : (1, -1, None, None, 'ACCGGT'),
1469 'ovhgseq' : 'CCGG',
1470 }
1471 rest_dict['AsiGI'] = _temp()
1472
1474 return {
1475 'compsite' : '(?P<AsiSI>GCGATCGC)|(?P<AsiSI_as>GCGATCGC)',
1476 'results' : None,
1477 'site' : 'GCGATCGC',
1478 'substrat' : 'DNA',
1479 'fst3' : -5,
1480 'fst5' : 5,
1481 'freq' : 65536,
1482 'size' : 8,
1483 'opt_temp' : 37,
1484 'dna' : None,
1485 'inact_temp' : 65,
1486 'ovhg' : 2,
1487 'scd3' : None,
1488 'suppl' : ('N',),
1489 'scd5' : None,
1490 'charac' : (5, -5, None, None, 'GCGATCGC'),
1491 'ovhgseq' : 'AT',
1492 }
1493 rest_dict['AsiSI'] = _temp()
1494
1496 return {
1497 'compsite' : '(?P<Asp700I>GAA....TTC)|(?P<Asp700I_as>GAA....TTC)',
1498 'results' : None,
1499 'site' : 'GAANNNNTTC',
1500 'substrat' : 'DNA',
1501 'fst3' : -5,
1502 'fst5' : 5,
1503 'freq' : 4096,
1504 'size' : 10,
1505 'opt_temp' : 37,
1506 'dna' : None,
1507 'inact_temp' : 65,
1508 'ovhg' : 0,
1509 'scd3' : None,
1510 'suppl' : ('M',),
1511 'scd5' : None,
1512 'charac' : (5, -5, None, None, 'GAANNNNTTC'),
1513 'ovhgseq' : '',
1514 }
1515 rest_dict['Asp700I'] = _temp()
1516
1518 return {
1519 'compsite' : '(?P<Asp718I>GGTACC)|(?P<Asp718I_as>GGTACC)',
1520 'results' : None,
1521 'site' : 'GGTACC',
1522 'substrat' : 'DNA',
1523 'fst3' : -1,
1524 'fst5' : 1,
1525 'freq' : 4096,
1526 'size' : 6,
1527 'opt_temp' : 37,
1528 'dna' : None,
1529 'inact_temp' : 65,
1530 'ovhg' : -4,
1531 'scd3' : None,
1532 'suppl' : ('M',),
1533 'scd5' : None,
1534 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGTACC'),
1535 'ovhgseq' : 'GTAC',
1536 }
1537 rest_dict['Asp718I'] = _temp()
1538
1540 return {
1541 'compsite' : '(?P<AspA2I>CCTAGG)|(?P<AspA2I_as>CCTAGG)',
1542 'results' : None,
1543 'site' : 'CCTAGG',
1544 'substrat' : 'DNA',
1545 'fst3' : -1,
1546 'fst5' : 1,
1547 'freq' : 4096,
1548 'size' : 6,
1549 'opt_temp' : 37,
1550 'dna' : None,
1551 'inact_temp' : 65,
1552 'ovhg' : -4,
1553 'scd3' : None,
1554 'suppl' : ('I', 'V'),
1555 'scd5' : None,
1556 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCTAGG'),
1557 'ovhgseq' : 'CTAG',
1558 }
1559 rest_dict['AspA2I'] = _temp()
1560
1562 return {
1563 'compsite' : '(?P<AspCNI>GCCGC)|(?P<AspCNI_as>GCGGC)',
1564 'results' : None,
1565 'site' : 'GCCGC',
1566 'substrat' : 'DNA',
1567 'fst3' : None,
1568 'fst5' : None,
1569 'freq' : 1024,
1570 'size' : 5,
1571 'opt_temp' : 37,
1572 'dna' : None,
1573 'inact_temp' : 65,
1574 'ovhg' : None,
1575 'scd3' : None,
1576 'suppl' : (),
1577 'scd5' : None,
1578 'charac' : (None, None, None, None, 'GCCGC'),
1579 'ovhgseq' : None,
1580 }
1581 rest_dict['AspCNI'] = _temp()
1582
1584 return {
1585 'compsite' : '(?P<AspEI>GAC.....GTC)|(?P<AspEI_as>GAC.....GTC)',
1586 'results' : None,
1587 'site' : 'GACNNNNNGTC',
1588 'substrat' : 'DNA',
1589 'fst3' : -6,
1590 'fst5' : 6,
1591 'freq' : 4096,
1592 'size' : 11,
1593 'opt_temp' : 37,
1594 'dna' : None,
1595 'inact_temp' : 65,
1596 'ovhg' : 1,
1597 'scd3' : None,
1598 'suppl' : ('M',),
1599 'scd5' : None,
1600 'charac' : (6, -6, None, None, 'GACNNNNNGTC'),
1601 'ovhgseq' : 'N',
1602 }
1603 rest_dict['AspEI'] = _temp()
1604
1606 return {
1607 'compsite' : '(?P<AspI>GAC...GTC)|(?P<AspI_as>GAC...GTC)',
1608 'results' : None,
1609 'site' : 'GACNNNGTC',
1610 'substrat' : 'DNA',
1611 'fst3' : -4,
1612 'fst5' : 4,
1613 'freq' : 4096,
1614 'size' : 9,
1615 'opt_temp' : 37,
1616 'dna' : None,
1617 'inact_temp' : 65,
1618 'ovhg' : -1,
1619 'scd3' : None,
1620 'suppl' : ('M',),
1621 'scd5' : None,
1622 'charac' : (4, -4, None, None, 'GACNNNGTC'),
1623 'ovhgseq' : 'N',
1624 }
1625 rest_dict['AspI'] = _temp()
1626
1628 return {
1629 'compsite' : '(?P<AspLEI>GCGC)|(?P<AspLEI_as>GCGC)',
1630 'results' : None,
1631 'site' : 'GCGC',
1632 'substrat' : 'DNA',
1633 'fst3' : -3,
1634 'fst5' : 3,
1635 'freq' : 256,
1636 'size' : 4,
1637 'opt_temp' : 37,
1638 'dna' : None,
1639 'inact_temp' : 65,
1640 'ovhg' : 2,
1641 'scd3' : None,
1642 'suppl' : ('I', 'V'),
1643 'scd5' : None,
1644 'charac' : (3, -3, None, None, 'GCGC'),
1645 'ovhgseq' : 'CG',
1646 }
1647 rest_dict['AspLEI'] = _temp()
1648
1650 return {
1651 'compsite' : '(?P<AspS9I>GG.CC)|(?P<AspS9I_as>GG.CC)',
1652 'results' : None,
1653 'site' : 'GGNCC',
1654 'substrat' : 'DNA',
1655 'fst3' : -1,
1656 'fst5' : 1,
1657 'freq' : 256,
1658 'size' : 5,
1659 'opt_temp' : 37,
1660 'dna' : None,
1661 'inact_temp' : 65,
1662 'ovhg' : -3,
1663 'scd3' : None,
1664 'suppl' : ('I', 'V'),
1665 'scd5' : None,
1666 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGNCC'),
1667 'ovhgseq' : 'GNC',
1668 }
1669 rest_dict['AspS9I'] = _temp()
1670
1672 return {
1673 'compsite' : '(?P<AssI>AGTACT)|(?P<AssI_as>AGTACT)',
1674 'results' : None,
1675 'site' : 'AGTACT',
1676 'substrat' : 'DNA',
1677 'fst3' : -3,
1678 'fst5' : 3,
1679 'freq' : 4096,
1680 'size' : 6,
1681 'opt_temp' : 37,
1682 'dna' : None,
1683 'inact_temp' : 65,
1684 'ovhg' : 0,
1685 'scd3' : None,
1686 'suppl' : ('U',),
1687 'scd5' : None,
1688 'charac' : (3, -3, None, None, 'AGTACT'),
1689 'ovhgseq' : '',
1690 }
1691 rest_dict['AssI'] = _temp()
1692
1694 return {
1695 'compsite' : '(?P<AsuC2I>CC[CG]GG)|(?P<AsuC2I_as>CC[CG]GG)',
1696 'results' : None,
1697 'site' : 'CCSGG',
1698 'substrat' : 'DNA',
1699 'fst3' : -2,
1700 'fst5' : 2,
1701 'freq' : 512,
1702 'size' : 5,
1703 'opt_temp' : 37,
1704 'dna' : None,
1705 'inact_temp' : 65,
1706 'ovhg' : -1,
1707 'scd3' : None,
1708 'suppl' : ('I',),
1709 'scd5' : None,
1710 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCSGG'),
1711 'ovhgseq' : 'S',
1712 }
1713 rest_dict['AsuC2I'] = _temp()
1714
1716 return {
1717 'compsite' : '(?P<AsuHPI>GGTGA)|(?P<AsuHPI_as>TCACC)',
1718 'results' : None,
1719 'site' : 'GGTGA',
1720 'substrat' : 'DNA',
1721 'fst3' : 7,
1722 'fst5' : 13,
1723 'freq' : 1024,
1724 'size' : 5,
1725 'opt_temp' : 37,
1726 'dna' : None,
1727 'inact_temp' : 65,
1728 'ovhg' : 1,
1729 'scd3' : None,
1730 'suppl' : ('I', 'V'),
1731 'scd5' : None,
1732 'charac' : (13, 7, None, None, 'GGTGA'),
1733 'ovhgseq' : 'N',
1734 }
1735 rest_dict['AsuHPI'] = _temp()
1736
1738 return {
1739 'compsite' : '(?P<AsuI>GG.CC)|(?P<AsuI_as>GG.CC)',
1740 'results' : None,
1741 'site' : 'GGNCC',
1742 'substrat' : 'DNA',
1743 'fst3' : -1,
1744 'fst5' : 1,
1745 'freq' : 256,
1746 'size' : 5,
1747 'opt_temp' : 37,
1748 'dna' : None,
1749 'inact_temp' : 65,
1750 'ovhg' : -3,
1751 'scd3' : None,
1752 'suppl' : (),
1753 'scd5' : None,
1754 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGNCC'),
1755 'ovhgseq' : 'GNC',
1756 }
1757 rest_dict['AsuI'] = _temp()
1758
1760 return {
1761 'compsite' : '(?P<AsuII>TTCGAA)|(?P<AsuII_as>TTCGAA)',
1762 'results' : None,
1763 'site' : 'TTCGAA',
1764 'substrat' : 'DNA',
1765 'fst3' : -2,
1766 'fst5' : 2,
1767 'freq' : 4096,
1768 'size' : 6,
1769 'opt_temp' : 37,
1770 'dna' : None,
1771 'inact_temp' : 65,
1772 'ovhg' : -2,
1773 'scd3' : None,
1774 'suppl' : ('C',),
1775 'scd5' : None,
1776 'charac' : (2, -2, None, None, 'TTCGAA'),
1777 'ovhgseq' : 'CG',
1778 }
1779 rest_dict['AsuII'] = _temp()
1780
1782 return {
1783 'compsite' : '(?P<AsuNHI>GCTAGC)|(?P<AsuNHI_as>GCTAGC)',
1784 'results' : None,
1785 'site' : 'GCTAGC',
1786 'substrat' : 'DNA',
1787 'fst3' : -1,
1788 'fst5' : 1,
1789 'freq' : 4096,
1790 'size' : 6,
1791 'opt_temp' : 37,
1792 'dna' : None,
1793 'inact_temp' : 65,
1794 'ovhg' : -4,
1795 'scd3' : None,
1796 'suppl' : ('I', 'V'),
1797 'scd5' : None,
1798 'charac' : (1, -1, None, None, 'GCTAGC'),
1799 'ovhgseq' : 'CTAG',
1800 }
1801 rest_dict['AsuNHI'] = _temp()
1802
1804 return {
1805 'compsite' : '(?P<AvaI>C[CT]CG[AG]G)|(?P<AvaI_as>C[CT]CG[AG]G)',
1806 'results' : None,
1807 'site' : 'CYCGRG',
1808 'substrat' : 'DNA',
1809 'fst3' : -1,
1810 'fst5' : 1,
1811 'freq' : 1024,
1812 'size' : 6,
1813 'opt_temp' : 37,
1814 'dna' : None,
1815 'inact_temp' : 65,
1816 'ovhg' : -4,
1817 'scd3' : None,
1818 'suppl' : ('B', 'J', 'M', 'N', 'O', 'R', 'S', 'U', 'W', 'X'),
1819 'scd5' : None,
1820 'charac' : (1, -1, None, None, 'CYCGRG'),
1821 'ovhgseq' : 'YCGR',
1822 }
1823 rest_dict['AvaI'] = _temp()
1824
1826 return {
1827 'compsite' : '(?P<AvaII>GG[AT]CC)|(?P<AvaII_as>GG[AT]CC)',
1828 'results' : None,
1829 'site' : 'GGWCC',
1830 'substrat' : 'DNA',
1831 'fst3' : -1,
1832 'fst5' : 1,
1833 'freq' : 512,
1834 'size' : 5,
1835 'opt_temp' : 37,
1836 'dna' : None,
1837 'inact_temp' : 65,
1838 'ovhg' : -3,
1839 'scd3' : None,
1840 'suppl' : ('J', 'K', 'M', 'N', 'R', 'S', 'W', 'Y'),
1841 'scd5' : None,
1842 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGWCC'),
1843 'ovhgseq' : 'GWC',
1844 }
1845 rest_dict['AvaII'] = _temp()
1846
1848 return {
1849 'compsite' : '(?P<AvaIII>ATGCAT)|(?P<AvaIII_as>ATGCAT)',
1850 'results' : None,
1851 'site' : 'ATGCAT',
1852 'substrat' : 'DNA',
1853 'fst3' : None,
1854 'fst5' : None,
1855 'freq' : 4096,
1856 'size' : 6,
1857 'opt_temp' : 37,
1858 'dna' : None,
1859 'inact_temp' : 65,
1860 'ovhg' : None,
1861 'scd3' : None,
1862 'suppl' : (),
1863 'scd5' : None,
1864 'charac' : (None, None, None, None, 'ATGCAT'),
1865 'ovhgseq' : None,
1866 }
1867 rest_dict['AvaIII'] = _temp()
1868
1870 return {
1871 'compsite' : '(?P<AviII>TGCGCA)|(?P<AviII_as>TGCGCA)',
1872 'results' : None,
1873 'site' : 'TGCGCA',
1874 'substrat' : 'DNA',
1875 'fst3' : -3,
1876 'fst5' : 3,
1877 'freq' : 4096,
1878 'size' : 6,
1879 'opt_temp' : 37,
1880 'dna' : None,
1881 'inact_temp' : 65,
1882 'ovhg' : 0,
1883 'scd3' : None,
1884 'suppl' : ('M',),
1885 'scd5' : None,
1886 'charac' : (3, -3, None, None, 'TGCGCA'),
1887 'ovhgseq' : '',
1888 }
1889 rest_dict['AviII'] = _temp()
1890
1892 return {
1893 'compsite' : '(?P<AvrII>CCTAGG)|(?P<AvrII_as>CCTAGG)',
1894 'results' : None,
1895 'site' : 'CCTAGG',
1896 'substrat' : 'DNA',
1897 'fst3' : -1,
1898 'fst5' : 1,
1899 'freq' : 4096,
1900 'size' : 6,
1901 'opt_temp' : 37,
1902 'dna' : None,
1903 'inact_temp' : 65,
1904 'ovhg' : -4,
1905 'scd3' : None,
1906 'suppl' : ('N',),
1907 'scd5' : None,
1908 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCTAGG'),
1909 'ovhgseq' : 'CTAG',
1910 }
1911 rest_dict['AvrII'] = _temp()
1912
1914 return {
1915 'compsite' : '(?P<AxyI>CCT.AGG)|(?P<AxyI_as>CCT.AGG)',
1916 'results' : None,
1917 'site' : 'CCTNAGG',
1918 'substrat' : 'DNA',
1919 'fst3' : -2,
1920 'fst5' : 2,
1921 'freq' : 4096,
1922 'size' : 7,
1923 'opt_temp' : 37,
1924 'dna' : None,
1925 'inact_temp' : 65,
1926 'ovhg' : -3,
1927 'scd3' : None,
1928 'suppl' : ('J',),
1929 'scd5' : None,
1930 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCTNAGG'),
1931 'ovhgseq' : 'TNA',
1932 }
1933 rest_dict['AxyI'] = _temp()
1934
1936 return {
1937 'compsite' : '(?P<BaeGI>G[GT]GC[AC]C)|(?P<BaeGI_as>G[GT]GC[AC]C)',
1938 'results' : None,
1939 'site' : 'GKGCMC',
1940 'substrat' : 'DNA',
1941 'fst3' : -5,
1942 'fst5' : 5,
1943 'freq' : 1024,
1944 'size' : 6,
1945 'opt_temp' : 37,
1946 'dna' : None,
1947 'inact_temp' : 65,
1948 'ovhg' : 4,
1949 'scd3' : None,
1950 'suppl' : ('N',),
1951 'scd5' : None,
1952 'charac' : (5, -5, None, None, 'GKGCMC'),
1953 'ovhgseq' : 'KGCM',
1954 }
1955 rest_dict['BaeGI'] = _temp()
1956
1958 return {
1959 'compsite' : '(?P<BaeI>AC....GTA[CT]C)|(?P<BaeI_as>G[AG]TAC....GT)',
1960 'results' : None,
1961 'site' : 'ACNNNNGTAYC',
1962 'substrat' : 'DNA',
1963 'fst3' : -26,
1964 'fst5' : -10,
1965 'freq' : 8192,
1966 'size' : 11,
1967 'opt_temp' : 37,
1968 'dna' : None,
1969 'inact_temp' : 65,
1970 'ovhg' : 5,
1971 'scd3' : 7,
1972 'suppl' : ('N',),
1973 'scd5' : 23,
1974 'charac' : (-10, -26, 23, 7, 'ACNNNNGTAYC'),
1975 'ovhgseq' : 'NNNNN',
1976 }
1977 rest_dict['BaeI'] = _temp()
1978
1980 return {
1981 'compsite' : '(?P<BalI>TGGCCA)|(?P<BalI_as>TGGCCA)',
1982 'results' : None,
1983 'site' : 'TGGCCA',
1984 'substrat' : 'DNA',
1985 'fst3' : -3,
1986 'fst5' : 3,
1987 'freq' : 4096,
1988 'size' : 6,
1989 'opt_temp' : 37,
1990 'dna' : None,
1991 'inact_temp' : 65,
1992 'ovhg' : 0,
1993 'scd3' : None,
1994 'suppl' : ('J', 'K', 'R', 'X'),
1995 'scd5' : None,
1996 'charac' : (3, -3, None, None, 'TGGCCA'),
1997 'ovhgseq' : '',
1998 }
1999 rest_dict['BalI'] = _temp()
2000
2002 return {
2003 'compsite' : '(?P<BamHI>GGATCC)|(?P<BamHI_as>GGATCC)',
2004 'results' : None,
2005 'site' : 'GGATCC',
2006 'substrat' : 'DNA',
2007 'fst3' : -1,
2008 'fst5' : 1,
2009 'freq' : 4096,
2010 'size' : 6,
2011 'opt_temp' : 37,
2012 'dna' : None,
2013 'inact_temp' : 65,
2014 'ovhg' : -4,
2015 'scd3' : None,
2016 'suppl' : ('B', 'C', 'F', 'H', 'I', 'J', 'K', 'M', 'N', 'O', 'Q', 'R', 'S', 'U', 'V', 'W', 'X', 'Y'),
2017 'scd5' : None,
2018 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGATCC'),
2019 'ovhgseq' : 'GATC',
2020 }
2021 rest_dict['BamHI'] = _temp()
2022
2024 return {
2025 'compsite' : '(?P<BanI>GG[CT][AG]CC)|(?P<BanI_as>GG[CT][AG]CC)',
2026 'results' : None,
2027 'site' : 'GGYRCC',
2028 'substrat' : 'DNA',
2029 'fst3' : -1,
2030 'fst5' : 1,
2031 'freq' : 1024,
2032 'size' : 6,
2033 'opt_temp' : 37,
2034 'dna' : None,
2035 'inact_temp' : 65,
2036 'ovhg' : -4,
2037 'scd3' : None,
2038 'suppl' : ('N', 'O', 'R', 'U'),
2039 'scd5' : None,
2040 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGYRCC'),
2041 'ovhgseq' : 'GYRC',
2042 }
2043 rest_dict['BanI'] = _temp()
2044
2046 return {
2047 'compsite' : '(?P<BanII>G[AG]GC[CT]C)|(?P<BanII_as>G[AG]GC[CT]C)',
2048 'results' : None,
2049 'site' : 'GRGCYC',
2050 'substrat' : 'DNA',
2051 'fst3' : -5,
2052 'fst5' : 5,
2053 'freq' : 1024,
2054 'size' : 6,
2055 'opt_temp' : 37,
2056 'dna' : None,
2057 'inact_temp' : 65,
2058 'ovhg' : 4,
2059 'scd3' : None,
2060 'suppl' : ('K', 'N', 'O', 'Q', 'R', 'W', 'X'),
2061 'scd5' : None,
2062 'charac' : (5, -5, None, None, 'GRGCYC'),
2063 'ovhgseq' : 'RGCY',
2064 }
2065 rest_dict['BanII'] = _temp()
2066
2068 return {
2069 'compsite' : '(?P<BanIII>ATCGAT)|(?P<BanIII_as>ATCGAT)',
2070 'results' : None,
2071 'site' : 'ATCGAT',
2072 'substrat' : 'DNA',
2073 'fst3' : -2,
2074 'fst5' : 2,
2075 'freq' : 4096,
2076 'size' : 6,
2077 'opt_temp' : 37,
2078 'dna' : None,
2079 'inact_temp' : 65,
2080 'ovhg' : -2,
2081 'scd3' : None,
2082 'suppl' : ('O',),
2083 'scd5' : None,
2084 'charac' : (2, -2, None, None, 'ATCGAT'),
2085 'ovhgseq' : 'CG',
2086 }
2087 rest_dict['BanIII'] = _temp()
2088
2090 return {
2091 'compsite' : '(?P<BarI>GAAG......TAC)|(?P<BarI_as>GTA......CTTC)',
2092 'results' : None,
2093 'site' : 'GAAGNNNNNNTAC',
2094 'substrat' : 'DNA',
2095 'fst3' : -25,
2096 'fst5' : -7,
2097 'freq' : 16384,
2098 'size' : 13,
2099 'opt_temp' : 37,
2100 'dna' : None,
2101 'inact_temp' : 65,
2102 'ovhg' : 5,
2103 'scd3' : 7,
2104 'suppl' : ('I',),
2105 'scd5' : 25,
2106 'charac' : (-7, -25, 25, 7, 'GAAGNNNNNNTAC'),
2107 'ovhgseq' : 'NNNNN',
2108 }
2109 rest_dict['BarI'] = _temp()
2110
2112 return {
2113 'compsite' : '(?P<BasI>CCA.....TGG)|(?P<BasI_as>CCA.....TGG)',
2114 'results' : None,
2115 'site' : 'CCANNNNNTGG',
2116 'substrat' : 'DNA',
2117 'fst3' : -7,
2118 'fst5' : 7,
2119 'freq' : 4096,
2120 'size' : 11,
2121 'opt_temp' : 37,
2122 'dna' : None,
2123 'inact_temp' : 65,
2124 'ovhg' : 3,
2125 'scd3' : None,
2126 'suppl' : ('U',),
2127 'scd5' : None,
2128 'charac' : (7, -7, None, None, 'CCANNNNNTGG'),
2129 'ovhgseq' : 'NNN',
2130 }
2131 rest_dict['BasI'] = _temp()
2132
2134 return {
2135 'compsite' : '(?P<BauI>CACGAG)|(?P<BauI_as>CTCGTG)',
2136 'results' : None,
2137 'site' : 'CACGAG',
2138 'substrat' : 'DNA',
2139 'fst3' : -1,
2140 'fst5' : 1,
2141 'freq' : 4096,
2142 'size' : 6,
2143 'opt_temp' : 37,
2144 'dna' : None,
2145 'inact_temp' : 65,
2146 'ovhg' : -4,
2147 'scd3' : None,
2148 'suppl' : ('F',),
2149 'scd5' : None,
2150 'charac' : (1, -1, None, None, 'CACGAG'),
2151 'ovhgseq' : 'ACGA',
2152 }
2153 rest_dict['BauI'] = _temp()
2154
2156 return {
2157 'compsite' : '(?P<BbeI>GGCGCC)|(?P<BbeI_as>GGCGCC)',
2158 'results' : None,
2159 'site' : 'GGCGCC',
2160 'substrat' : 'DNA',
2161 'fst3' : -5,
2162 'fst5' : 5,
2163 'freq' : 4096,
2164 'size' : 6,
2165 'opt_temp' : 37,
2166 'dna' : None,
2167 'inact_temp' : 65,
2168 'ovhg' : 4,
2169 'scd3' : None,
2170 'suppl' : ('K',),
2171 'scd5' : None,
2172 'charac' : (5, -5, None, None, 'GGCGCC'),
2173 'ovhgseq' : 'GCGC',
2174 }
2175 rest_dict['BbeI'] = _temp()
2176
2178 return {
2179 'compsite' : '(?P<Bbr7I>GAAGAC)|(?P<Bbr7I_as>GTCTTC)',
2180 'results' : None,
2181 'site' : 'GAAGAC',
2182 'substrat' : 'DNA',
2183 'fst3' : 11,
2184 'fst5' : 13,
2185 'freq' : 4096,
2186 'size' : 6,
2187 'opt_temp' : 37,
2188 'dna' : None,
2189 'inact_temp' : 65,
2190 'ovhg' : -4,
2191 'scd3' : None,
2192 'suppl' : (),
2193 'scd5' : None,
2194 'charac' : (13, 11, None, None, 'GAAGAC'),
2195 'ovhgseq' : 'NNNN',
2196 }
2197 rest_dict['Bbr7I'] = _temp()
2198
2200 return {
2201 'compsite' : '(?P<BbrPI>CACGTG)|(?P<BbrPI_as>CACGTG)',
2202 'results' : None,
2203 'site' : 'CACGTG',
2204 'substrat' : 'DNA',
2205 'fst3' : -3,
2206 'fst5' : 3,
2207 'freq' : 4096,
2208 'size' : 6,
2209 'opt_temp' : 37,
2210 'dna' : None,
2211 'inact_temp' : 65,
2212 'ovhg' : 0,
2213 'scd3' : None,
2214 'suppl' : ('M', 'O'),
2215 'scd5' : None,
2216 'charac' : (3, -3, None, None, 'CACGTG'),
2217 'ovhgseq' : '',
2218 }
2219 rest_dict['BbrPI'] = _temp()
2220
2222 return {
2223 'compsite' : '(?P<BbsI>GAAGAC)|(?P<BbsI_as>GTCTTC)',
2224 'results' : None,
2225 'site' : 'GAAGAC',
2226 'substrat' : 'DNA',
2227 'fst3' : 6,
2228 'fst5' : 8,
2229 'freq' : 4096,
2230 'size' : 6,
2231 'opt_temp' : 37,
2232 'dna' : None,
2233 'inact_temp' : 65,
2234 'ovhg' : -4,
2235 'scd3' : None,
2236 'suppl' : ('N',),
2237 'scd5' : None,
2238 'charac' : (8, 6, None, None, 'GAAGAC'),
2239 'ovhgseq' : 'NNNN',
2240 }
2241 rest_dict['BbsI'] = _temp()
2242
2244 return {
2245 'compsite' : '(?P<BbuI>GCATGC)|(?P<BbuI_as>GCATGC)',
2246 'results' : None,
2247 'site' : 'GCATGC',
2248 'substrat' : 'DNA',
2249 'fst3' : -5,
2250 'fst5' : 5,
2251 'freq' : 4096,
2252 'size' : 6,
2253 'opt_temp' : 37,
2254 'dna' : None,
2255 'inact_temp' : 65,
2256 'ovhg' : 4,
2257 'scd3' : None,
2258 'suppl' : ('R',),
2259 'scd5' : None,
2260 'charac' : (5, -5, None, None, 'GCATGC'),
2261 'ovhgseq' : 'CATG',
2262 }
2263 rest_dict['BbuI'] = _temp()
2264
2266 return {
2267 'compsite' : '(?P<Bbv12I>G[AT]GC[AT]C)|(?P<Bbv12I_as>G[AT]GC[AT]C)',
2268 'results' : None,
2269 'site' : 'GWGCWC',
2270 'substrat' : 'DNA',
2271 'fst3' : -5,
2272 'fst5' : 5,
2273 'freq' : 1024,
2274 'size' : 6,
2275 'opt_temp' : 37,
2276 'dna' : None,
2277 'inact_temp' : 65,
2278 'ovhg' : 4,
2279 'scd3' : None,
2280 'suppl' : ('I', 'V'),
2281 'scd5' : None,
2282 'charac' : (5, -5, None, None, 'GWGCWC'),
2283 'ovhgseq' : 'WGCW',
2284 }
2285 rest_dict['Bbv12I'] = _temp()
2286
2288 return {
2289 'compsite' : '(?P<BbvCI>CCTCAGC)|(?P<BbvCI_as>GCTGAGG)',
2290 'results' : None,
2291 'site' : 'CCTCAGC',
2292 'substrat' : 'DNA',
2293 'fst3' : -2,
2294 'fst5' : 2,
2295 'freq' : 16384,
2296 'size' : 7,
2297 'opt_temp' : 37,
2298 'dna' : None,
2299 'inact_temp' : 65,
2300 'ovhg' : -3,
2301 'scd3' : None,
2302 'suppl' : ('N',),
2303 'scd5' : None,
2304 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCTCAGC'),
2305 'ovhgseq' : 'TCA',
2306 }
2307 rest_dict['BbvCI'] = _temp()
2308
2310 return {
2311 'compsite' : '(?P<BbvI>GCAGC)|(?P<BbvI_as>GCTGC)',
2312 'results' : None,
2313 'site' : 'GCAGC',
2314 'substrat' : 'DNA',
2315 'fst3' : 12,
2316 'fst5' : 13,
2317 'freq' : 1024,
2318 'size' : 5,
2319 'opt_temp' : 37,
2320 'dna' : None,
2321 'inact_temp' : 65,
2322 'ovhg' : -4,
2323 'scd3' : None,
2324 'suppl' : ('N',),
2325 'scd5' : None,
2326 'charac' : (13, 12, None, None, 'GCAGC'),
2327 'ovhgseq' : 'NNNN',
2328 }
2329 rest_dict['BbvI'] = _temp()
2330
2332 return {
2333 'compsite' : '(?P<BbvII>GAAGAC)|(?P<BbvII_as>GTCTTC)',
2334 'results' : None,
2335 'site' : 'GAAGAC',
2336 'substrat' : 'DNA',
2337 'fst3' : 6,
2338 'fst5' : 8,
2339 'freq' : 4096,
2340 'size' : 6,
2341 'opt_temp' : 37,
2342 'dna' : None,
2343 'inact_temp' : 65,
2344 'ovhg' : -4,
2345 'scd3' : None,
2346 'suppl' : (),
2347 'scd5' : None,
2348 'charac' : (8, 6, None, None, 'GAAGAC'),
2349 'ovhgseq' : 'NNNN',
2350 }
2351 rest_dict['BbvII'] = _temp()
2352
2354 return {
2355 'compsite' : '(?P<BccI>CCATC)|(?P<BccI_as>GATGG)',
2356 'results' : None,
2357 'site' : 'CCATC',
2358 'substrat' : 'DNA',
2359 'fst3' : 5,
2360 'fst5' : 9,
2361 'freq' : 1024,
2362 'size' : 5,
2363 'opt_temp' : 37,
2364 'dna' : None,
2365 'inact_temp' : 65,
2366 'ovhg' : -1,
2367 'scd3' : None,
2368 'suppl' : ('N',),
2369 'scd5' : None,
2370 'charac' : (9, 5, None, None, 'CCATC'),
2371 'ovhgseq' : 'N',
2372 }
2373 rest_dict['BccI'] = _temp()
2374
2376 return {
2377 'compsite' : '(?P<Bce83I>CTTGAG)|(?P<Bce83I_as>CTCAAG)',
2378 'results' : None,
2379 'site' : 'CTTGAG',
2380 'substrat' : 'DNA',
2381 'fst3' : 14,
2382 'fst5' : 22,
2383 'freq' : 4096,
2384 'size' : 6,
2385 'opt_temp' : 37,
2386 'dna' : None,
2387 'inact_temp' : 65,
2388 'ovhg' : 2,
2389 'scd3' : None,
2390 'suppl' : (),
2391 'scd5' : None,
2392 'charac' : (22, 14, None, None, 'CTTGAG'),
2393 'ovhgseq' : 'NN',
2394 }
2395 rest_dict['Bce83I'] = _temp()
2396
2398 return {
2399 'compsite' : '(?P<BceAI>ACGGC)|(?P<BceAI_as>GCCGT)',
2400 'results' : None,
2401 'site' : 'ACGGC',
2402 'substrat' : 'DNA',
2403 'fst3' : 14,
2404 'fst5' : 17,
2405 'freq' : 1024,
2406 'size' : 5,
2407 'opt_temp' : 37,
2408 'dna' : None,
2409 'inact_temp' : 65,
2410 'ovhg' : -2,
2411 'scd3' : None,
2412 'suppl' : ('N',),
2413 'scd5' : None,
2414 'charac' : (17, 14, None, None, 'ACGGC'),
2415 'ovhgseq' : 'NN',
2416 }
2417 rest_dict['BceAI'] = _temp()
2418
2420 return {
2421 'compsite' : '(?P<BcefI>ACGGC)|(?P<BcefI_as>GCCGT)',
2422 'results' : None,
2423 'site' : 'ACGGC',
2424 'substrat' : 'DNA',
2425 'fst3' : 13,
2426 'fst5' : 17,
2427 'freq' : 1024,
2428 'size' : 5,
2429 'opt_temp' : 37,
2430 'dna' : None,
2431 'inact_temp' : 65,
2432 'ovhg' : -1,
2433 'scd3' : None,
2434 'suppl' : (),
2435 'scd5' : None,
2436 'charac' : (17, 13, None, None, 'ACGGC'),
2437 'ovhgseq' : 'N',
2438 }
2439 rest_dict['BcefI'] = _temp()
2440
2442 return {
2443 'compsite' : '(?P<BcgI>CGA......TGC)|(?P<BcgI_as>GCA......TCG)',
2444 'results' : None,
2445 'site' : 'CGANNNNNNTGC',
2446 'substrat' : 'DNA',
2447 'fst3' : -24,
2448 'fst5' : -10,
2449 'freq' : 4096,
2450 'size' : 12,
2451 'opt_temp' : 37,
2452 'dna' : None,
2453 'inact_temp' : 65,
2454 'ovhg' : 2,
2455 'scd3' : 10,
2456 'suppl' : ('N',),
2457 'scd5' : 24,
2458 'charac' : (-10, -24, 24, 10, 'CGANNNNNNTGC'),
2459 'ovhgseq' : 'NN',
2460 }
2461 rest_dict['BcgI'] = _temp()
2462
2464 return {
2465 'compsite' : '(?P<BciVI>GTATCC)|(?P<BciVI_as>GGATAC)',
2466 'results' : None,
2467 'site' : 'GTATCC',
2468 'substrat' : 'DNA',
2469 'fst3' : 5,
2470 'fst5' : 12,
2471 'freq' : 4096,
2472 'size' : 6,
2473 'opt_temp' : 37,
2474 'dna' : None,
2475 'inact_temp' : 65,
2476 'ovhg' : 1,
2477 'scd3' : None,
2478 'suppl' : ('N',),
2479 'scd5' : None,
2480 'charac' : (12, 5, None, None, 'GTATCC'),
2481 'ovhgseq' : 'N',
2482 }
2483 rest_dict['BciVI'] = _temp()
2484
2486 return {
2487 'compsite' : '(?P<BclI>TGATCA)|(?P<BclI_as>TGATCA)',
2488 'results' : None,
2489 'site' : 'TGATCA',
2490 'substrat' : 'DNA',
2491 'fst3' : -1,
2492 'fst5' : 1,
2493 'freq' : 4096,
2494 'size' : 6,
2495 'opt_temp' : 37,
2496 'dna' : None,
2497 'inact_temp' : 65,
2498 'ovhg' : -4,
2499 'scd3' : None,
2500 'suppl' : ('C', 'F', 'J', 'M', 'N', 'O', 'R', 'S', 'U', 'W', 'Y'),
2501 'scd5' : None,
2502 'charac' : (1, -1, None, None, 'TGATCA'),
2503 'ovhgseq' : 'GATC',
2504 }
2505 rest_dict['BclI'] = _temp()
2506
2508 return {
2509 'compsite' : '(?P<BcnI>CC[CG]GG)|(?P<BcnI_as>CC[CG]GG)',
2510 'results' : None,
2511 'site' : 'CCSGG',
2512 'substrat' : 'DNA',
2513 'fst3' : -2,
2514 'fst5' : 2,
2515 'freq' : 512,
2516 'size' : 5,
2517 'opt_temp' : 37,
2518 'dna' : None,
2519 'inact_temp' : 65,
2520 'ovhg' : -1,
2521 'scd3' : None,
2522 'suppl' : ('F', 'K'),
2523 'scd5' : None,
2524 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCSGG'),
2525 'ovhgseq' : 'S',
2526 }
2527 rest_dict['BcnI'] = _temp()
2528
2530 return {
2531 'compsite' : '(?P<BcuI>ACTAGT)|(?P<BcuI_as>ACTAGT)',
2532 'results' : None,
2533 'site' : 'ACTAGT',
2534 'substrat' : 'DNA',
2535 'fst3' : -1,
2536 'fst5' : 1,
2537 'freq' : 4096,
2538 'size' : 6,
2539 'opt_temp' : 37,
2540 'dna' : None,
2541 'inact_temp' : 65,
2542 'ovhg' : -4,
2543 'scd3' : None,
2544 'suppl' : ('F',),
2545 'scd5' : None,
2546 'charac' : (1, -1, None, None, 'ACTAGT'),
2547 'ovhgseq' : 'CTAG',
2548 }
2549 rest_dict['BcuI'] = _temp()
2550
2552 return {
2553 'compsite' : '(?P<BdaI>TGA......TCA)|(?P<BdaI_as>TGA......TCA)',
2554 'results' : None,
2555 'site' : 'TGANNNNNNTCA',
2556 'substrat' : 'DNA',
2557 'fst3' : -24,
2558 'fst5' : -10,
2559 'freq' : 4096,
2560 'size' : 12,
2561 'opt_temp' : 37,
2562 'dna' : None,
2563 'inact_temp' : 65,
2564 'ovhg' : 2,
2565 'scd3' : 10,
2566 'suppl' : ('F',),
2567 'scd5' : 24,
2568 'charac' : (-10, -24, 24, 10, 'TGANNNNNNTCA'),
2569 'ovhgseq' : 'NN',
2570 }
2571 rest_dict['BdaI'] = _temp()
2572
2574 return {
2575 'compsite' : '(?P<BetI>[AT]CCGG[AT])|(?P<BetI_as>[AT]CCGG[AT])',
2576 'results' : None,
2577 'site' : 'WCCGGW',
2578 'substrat' : 'DNA',
2579 'fst3' : -1,
2580 'fst5' : 1,
2581 'freq' : 1024,
2582 'size' : 6,
2583 'opt_temp' : 37,
2584 'dna' : None,
2585 'inact_temp' : 65,
2586 'ovhg' : -4,
2587 'scd3' : None,
2588 'suppl' : (),
2589 'scd5' : None,
2590 'charac' : (1, -1, None, None, 'WCCGGW'),
2591 'ovhgseq' : 'CCGG',
2592 }
2593 rest_dict['BetI'] = _temp()
2594
2596 return {
2597 'compsite' : '(?P<BfaI>CTAG)|(?P<BfaI_as>CTAG)',
2598 'results' : None,
2599 'site' : 'CTAG',
2600 'substrat' : 'DNA',
2601 'fst3' : -1,
2602 'fst5' : 1,
2603 'freq' : 256,
2604 'size' : 4,
2605 'opt_temp' : 37,
2606 'dna' : None,
2607 'inact_temp' : 65,
2608 'ovhg' : -2,
2609 'scd3' : None,
2610 'suppl' : ('N',),
2611 'scd5' : None,
2612 'charac' : (1, -1, None, None, 'CTAG'),
2613 'ovhgseq' : 'TA',
2614 }
2615 rest_dict['BfaI'] = _temp()
2616
2618 return {
2619 'compsite' : '(?P<BfiI>ACTGGG)|(?P<BfiI_as>CCCAGT)',
2620 'results' : None,
2621 'site' : 'ACTGGG',
2622 'substrat' : 'DNA',
2623 'fst3' : 4,
2624 'fst5' : 11,
2625 'freq' : 4096,
2626 'size' : 6,
2627 'opt_temp' : 37,
2628 'dna' : None,
2629 'inact_temp' : 65,
2630 'ovhg' : 1,
2631 'scd3' : None,
2632 'suppl' : ('F',),
2633 'scd5' : None,
2634 'charac' : (11, 4, None, None, 'ACTGGG'),
2635 'ovhgseq' : 'N',
2636 }
2637 rest_dict['BfiI'] = _temp()
2638
2640 return {
2641 'compsite' : '(?P<BfmI>CT[AG][CT]AG)|(?P<BfmI_as>CT[AG][CT]AG)',
2642 'results' : None,
2643 'site' : 'CTRYAG',
2644 'substrat' : 'DNA',
2645 'fst3' : -1,
2646 'fst5' : 1,
2647 'freq' : 1024,
2648 'size' : 6,
2649 'opt_temp' : 37,
2650 'dna' : None,
2651 'inact_temp' : 65,
2652 'ovhg' : -4,
2653 'scd3' : None,
2654 'suppl' : ('F',),
2655 'scd5' : None,
2656 'charac' : (1, -1, None, None, 'CTRYAG'),
2657 'ovhgseq' : 'TRYA',
2658 }
2659 rest_dict['BfmI'] = _temp()
2660
2662 return {
2663 'compsite' : '(?P<BfoI>[AG]GCGC[CT])|(?P<BfoI_as>[AG]GCGC[CT])',
2664 'results' : None,
2665 'site' : 'RGCGCY',
2666 'substrat' : 'DNA',
2667 'fst3' : -5,
2668 'fst5' : 5,
2669 'freq' : 1024,
2670 'size' : 6,
2671 'opt_temp' : 37,
2672 'dna' : None,
2673 'inact_temp' : 65,
2674 'ovhg' : 4,
2675 'scd3' : None,
2676 'suppl' : ('F',),
2677 'scd5' : None,
2678 'charac' : (5, -5, None, None, 'RGCGCY'),
2679 'ovhgseq' : 'GCGC',
2680 }
2681 rest_dict['BfoI'] = _temp()
2682
2684 return {
2685 'compsite' : '(?P<BfrI>CTTAAG)|(?P<BfrI_as>CTTAAG)',
2686 'results' : None,
2687 'site' : 'CTTAAG',
2688 'substrat' : 'DNA',
2689 'fst3' : -1,
2690 'fst5' : 1,
2691 'freq' : 4096,
2692 'size' : 6,
2693 'opt_temp' : 37,
2694 'dna' : None,
2695 'inact_temp' : 65,
2696 'ovhg' : -4,
2697 'scd3' : None,
2698 'suppl' : ('M', 'O'),
2699 'scd5' : None,
2700 'charac' : (1, -1, None, None, 'CTTAAG'),
2701 'ovhgseq' : 'TTAA',
2702 }
2703 rest_dict['BfrI'] = _temp()
2704
2706 return {
2707 'compsite' : '(?P<BfuAI>ACCTGC)|(?P<BfuAI_as>GCAGGT)',
2708 'results' : None,
2709 'site' : 'ACCTGC',
2710 'substrat' : 'DNA',
2711 'fst3' : 8,
2712 'fst5' : 10,
2713 'freq' : 4096,
2714 'size' : 6,
2715 'opt_temp' : 37,
2716 'dna' : None,
2717 'inact_temp' : 65,
2718 'ovhg' : -4,
2719 'scd3' : None,
2720 'suppl' : ('N',),
2721 'scd5' : None,
2722 'charac' : (10, 8, None, None, 'ACCTGC'),
2723 'ovhgseq' : 'NNNN',
2724 }
2725 rest_dict['BfuAI'] = _temp()
2726
2728 return {
2729 'compsite' : '(?P<BfuCI>GATC)|(?P<BfuCI_as>GATC)',
2730 'results' : None,
2731 'site' : 'GATC',
2732 'substrat' : 'DNA',
2733 'fst3' : 0,
2734 'fst5' : 0,
2735 'freq' : 256,
2736 'size' : 4,
2737 'opt_temp' : 37,
2738 'dna' : None,
2739 'inact_temp' : 65,
2740 'ovhg' : -4,
2741 'scd3' : None,
2742 'suppl' : ('N',),
2743 'scd5' : None,
2744 'charac' : (0, 0, None, None, 'GATC'),
2745 'ovhgseq' : 'GATC',
2746 }
2747 rest_dict['BfuCI'] = _temp()
2748
2750 return {
2751 'compsite' : '(?P<BfuI>GTATCC)|(?P<BfuI_as>GGATAC)',
2752 'results' : None,
2753 'site' : 'GTATCC',
2754 'substrat' : 'DNA',
2755 'fst3' : 5,
2756 'fst5' : 12,
2757 'freq' : 4096,
2758 'size' : 6,
2759 'opt_temp' : 37,
2760 'dna' : None,
2761 'inact_temp' : 65,
2762 'ovhg' : 1,
2763 'scd3' : None,
2764 'suppl' : ('F',),
2765 'scd5' : None,
2766 'charac' : (12, 5, None, None, 'GTATCC'),
2767 'ovhgseq' : 'N',
2768 }
2769 rest_dict['BfuI'] = _temp()
2770
2772 return {
2773 'compsite' : '(?P<BglI>GCC.....GGC)|(?P<BglI_as>GCC.....GGC)',
2774 'results' : None,
2775 'site' : 'GCCNNNNNGGC',
2776 'substrat' : 'DNA',
2777 'fst3' : -7,
2778 'fst5' : 7,
2779 'freq' : 4096,
2780 'size' : 11,
2781 'opt_temp' : 37,
2782 'dna' : None,
2783 'inact_temp' : 65,
2784 'ovhg' : 3,
2785 'scd3' : None,
2786 'suppl' : ('C', 'F', 'H', 'I', 'J', 'K', 'M', 'N', 'O', 'Q', 'R', 'S', 'U', 'V', 'W', 'X', 'Y'),
2787 'scd5' : None,
2788 'charac' : (7, -7, None, None, 'GCCNNNNNGGC'),
2789 'ovhgseq' : 'NNN',
2790 }
2791 rest_dict['BglI'] = _temp()
2792
2794 return {
2795 'compsite' : '(?P<BglII>AGATCT)|(?P<BglII_as>AGATCT)',
2796 'results' : None,
2797 'site' : 'AGATCT',
2798 'substrat' : 'DNA',
2799 'fst3' : -1,
2800 'fst5' : 1,
2801 'freq' : 4096,
2802 'size' : 6,
2803 'opt_temp' : 37,
2804 'dna' : None,
2805 'inact_temp' : 65,
2806 'ovhg' : -4,
2807 'scd3' : None,
2808 'suppl' : ('B', 'C', 'F', 'H', 'I', 'J', 'K', 'M', 'N', 'O', 'Q', 'R', 'S', 'U', 'V', 'W', 'X', 'Y'),
2809 'scd5' : None,
2810 'charac' : (1, -1, None, None, 'AGATCT'),
2811 'ovhgseq' : 'GATC',
2812 }
2813 rest_dict['BglII'] = _temp()
2814
2816 return {
2817 'compsite' : '(?P<BinI>GGATC)|(?P<BinI_as>GATCC)',
2818 'results' : None,
2819 'site' : 'GGATC',
2820 'substrat' : 'DNA',
2821 'fst3' : 5,
2822 'fst5' : 9,
2823 'freq' : 1024,
2824 'size' : 5,
2825 'opt_temp' : 37,
2826 'dna' : None,
2827 'inact_temp' : 65,
2828 'ovhg' : -1,
2829 'scd3' : None,
2830 'suppl' : (),
2831 'scd5' : None,
2832 'charac' : (9, 5, None, None, 'GGATC'),
2833 'ovhgseq' : 'N',
2834 }
2835 rest_dict['BinI'] = _temp()
2836
2838 return {
2839 'compsite' : '(?P<BisI>GC.GC)|(?P<BisI_as>GC.GC)',
2840 'results' : None,
2841 'site' : 'GCNGC',
2842 'substrat' : 'DNA',
2843 'fst3' : -2,
2844 'fst5' : 2,
2845 'freq' : 256,
2846 'size' : 5,
2847 'opt_temp' : 37,
2848 'dna' : None,
2849 'inact_temp' : 65,
2850 'ovhg' : -1,
2851 'scd3' : None,
2852 'suppl' : ('I',),
2853 'scd5' : None,
2854 'charac' : (2, -2, None, None, 'GCNGC'),
2855 'ovhgseq' : 'N',
2856 }
2857 rest_dict['BisI'] = _temp()
2858
2860 return {
2861 'compsite' : '(?P<BlnI>CCTAGG)|(?P<BlnI_as>CCTAGG)',
2862 'results' : None,
2863 'site' : 'CCTAGG',
2864 'substrat' : 'DNA',
2865 'fst3' : -1,
2866 'fst5' : 1,
2867 'freq' : 4096,
2868 'size' : 6,
2869 'opt_temp' : 37,
2870 'dna' : None,
2871 'inact_temp' : 65,
2872 'ovhg' : -4,
2873 'scd3' : None,
2874 'suppl' : ('K', 'M', 'S'),
2875 'scd5' : None,
2876 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCTAGG'),
2877 'ovhgseq' : 'CTAG',
2878 }
2879 rest_dict['BlnI'] = _temp()
2880
2882 return {
2883 'compsite' : '(?P<BlpI>GCT.AGC)|(?P<BlpI_as>GCT.AGC)',
2884 'results' : None,
2885 'site' : 'GCTNAGC',
2886 'substrat' : 'DNA',
2887 'fst3' : -2,
2888 'fst5' : 2,
2889 'freq' : 4096,
2890 'size' : 7,
2891 'opt_temp' : 37,
2892 'dna' : None,
2893 'inact_temp' : 65,
2894 'ovhg' : -3,
2895 'scd3' : None,
2896 'suppl' : ('N',),
2897 'scd5' : None,
2898 'charac' : (2, -2, None, None, 'GCTNAGC'),
2899 'ovhgseq' : 'TNA',
2900 }
2901 rest_dict['BlpI'] = _temp()
2902
2904 return {
2905 'compsite' : '(?P<BlsI>GC.GC)|(?P<BlsI_as>GC.GC)',
2906 'results' : None,
2907 'site' : 'GCNGC',
2908 'substrat' : 'DNA',
2909 'fst3' : -3,
2910 'fst5' : 3,
2911 'freq' : 256,
2912 'size' : 5,
2913 'opt_temp' : 37,
2914 'dna' : None,
2915 'inact_temp' : 65,
2916 'ovhg' : 1,
2917 'scd3' : None,
2918 'suppl' : ('I',),
2919 'scd5' : None,
2920 'charac' : (3, -3, None, None, 'GCNGC'),
2921 'ovhgseq' : 'N',
2922 }
2923 rest_dict['BlsI'] = _temp()
2924
2926 return {
2927 'compsite' : '(?P<BmcAI>AGTACT)|(?P<BmcAI_as>AGTACT)',
2928 'results' : None,
2929 'site' : 'AGTACT',
2930 'substrat' : 'DNA',
2931 'fst3' : -3,
2932 'fst5' : 3,
2933 'freq' : 4096,
2934 'size' : 6,
2935 'opt_temp' : 37,
2936 'dna' : None,
2937 'inact_temp' : 65,
2938 'ovhg' : 0,
2939 'scd3' : None,
2940 'suppl' : ('V',),
2941 'scd5' : None,
2942 'charac' : (3, -3, None, None, 'AGTACT'),
2943 'ovhgseq' : '',
2944 }
2945 rest_dict['BmcAI'] = _temp()
2946
2948 return {
2949 'compsite' : '(?P<Bme1390I>CC.GG)|(?P<Bme1390I_as>CC.GG)',
2950 'results' : None,
2951 'site' : 'CCNGG',
2952 'substrat' : 'DNA',
2953 'fst3' : -2,
2954 'fst5' : 2,
2955 'freq' : 256,
2956 'size' : 5,
2957 'opt_temp' : 37,
2958 'dna' : None,
2959 'inact_temp' : 65,
2960 'ovhg' : -1,
2961 'scd3' : None,
2962 'suppl' : ('F',),
2963 'scd5' : None,
2964 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCNGG'),
2965 'ovhgseq' : 'N',
2966 }
2967 rest_dict['Bme1390I'] = _temp()
2968
2970 return {
2971 'compsite' : '(?P<Bme18I>GG[AT]CC)|(?P<Bme18I_as>GG[AT]CC)',
2972 'results' : None,
2973 'site' : 'GGWCC',
2974 'substrat' : 'DNA',
2975 'fst3' : -1,
2976 'fst5' : 1,
2977 'freq' : 512,
2978 'size' : 5,
2979 'opt_temp' : 37,
2980 'dna' : None,
2981 'inact_temp' : 65,
2982 'ovhg' : -3,
2983 'scd3' : None,
2984 'suppl' : ('I', 'V'),
2985 'scd5' : None,
2986 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGWCC'),
2987 'ovhgseq' : 'GWC',
2988 }
2989 rest_dict['Bme18I'] = _temp()
2990
2992 return {
2993 'compsite' : '(?P<BmeRI>GAC.....GTC)|(?P<BmeRI_as>GAC.....GTC)',
2994 'results' : None,
2995 'site' : 'GACNNNNNGTC',
2996 'substrat' : 'DNA',
2997 'fst3' : -6,
2998 'fst5' : 6,
2999 'freq' : 4096,
3000 'size' : 11,
3001 'opt_temp' : 37,
3002 'dna' : None,
3003 'inact_temp' : 65,
3004 'ovhg' : 1,
3005 'scd3' : None,
3006 'suppl' : ('V',),
3007 'scd5' : None,
3008 'charac' : (6, -6, None, None, 'GACNNNNNGTC'),
3009 'ovhgseq' : 'N',
3010 }
3011 rest_dict['BmeRI'] = _temp()
3012
3014 return {
3015 'compsite' : '(?P<BmeT110I>C[CT]CG[AG]G)|(?P<BmeT110I_as>C[CT]CG[AG]G)',
3016 'results' : None,
3017 'site' : 'CYCGRG',
3018 'substrat' : 'DNA',
3019 'fst3' : -1,
3020 'fst5' : 1,
3021 'freq' : 1024,
3022 'size' : 6,
3023 'opt_temp' : 37,
3024 'dna' : None,
3025 'inact_temp' : 65,
3026 'ovhg' : -4,
3027 'scd3' : None,
3028 'suppl' : ('K',),
3029 'scd5' : None,
3030 'charac' : (1, -1, None, None, 'CYCGRG'),
3031 'ovhgseq' : 'YCGR',
3032 }
3033 rest_dict['BmeT110I'] = _temp()
3034
3036 return {
3037 'compsite' : '(?P<BmgBI>CACGTC)|(?P<BmgBI_as>GACGTG)',
3038 'results' : None,
3039 'site' : 'CACGTC',
3040 'substrat' : 'DNA',
3041 'fst3' : -3,
3042 'fst5' : 3,
3043 'freq' : 4096,
3044 'size' : 6,
3045 'opt_temp' : 37,
3046 'dna' : None,
3047 'inact_temp' : 65,
3048 'ovhg' : 0,
3049 'scd3' : None,
3050 'suppl' : ('N',),
3051 'scd5' : None,
3052 'charac' : (3, -3, None, None, 'CACGTC'),
3053 'ovhgseq' : '',
3054 }
3055 rest_dict['BmgBI'] = _temp()
3056
3058 return {
3059 'compsite' : '(?P<BmgI>G[GT]GCCC)|(?P<BmgI_as>GGGC[AC]C)',
3060 'results' : None,
3061 'site' : 'GKGCCC',
3062 'substrat' : 'DNA',
3063 'fst3' : None,
3064 'fst5' : None,
3065 'freq' : 2048,
3066 'size' : 6,
3067 'opt_temp' : 37,
3068 'dna' : None,
3069 'inact_temp' : 65,
3070 'ovhg' : None,
3071 'scd3' : None,
3072 'suppl' : (),
3073 'scd5' : None,
3074 'charac' : (None, None, None, None, 'GKGCCC'),
3075 'ovhgseq' : None,
3076 }
3077 rest_dict['BmgI'] = _temp()
3078
3080 return {
3081 'compsite' : '(?P<BmgT120I>GG.CC)|(?P<BmgT120I_as>GG.CC)',
3082 'results' : None,
3083 'site' : 'GGNCC',
3084 'substrat' : 'DNA',
3085 'fst3' : -2,
3086 'fst5' : 2,
3087 'freq' : 256,
3088 'size' : 5,
3089 'opt_temp' : 37,
3090 'dna' : None,
3091 'inact_temp' : 65,
3092 'ovhg' : -1,
3093 'scd3' : None,
3094 'suppl' : ('K',),
3095 'scd5' : None,
3096 'charac' : (2, -2, None, None, 'GGNCC'),
3097 'ovhgseq' : 'N',
3098 }
3099 rest_dict['BmgT120I'] = _temp()
3100
3102 return {
3103 'compsite' : '(?P<BmiI>GG..CC)|(?P<BmiI_as>GG..CC)',
3104 'results' : None,
3105 'site' : 'GGNNCC',
3106 'substrat' : 'DNA',
3107 'fst3' : -3,
3108 'fst5' : 3,
3109 'freq' : 256,
3110 'size' : 6,
3111 'opt_temp' : 37,
3112 'dna' : None,
3113 'inact_temp' : 65,
3114 'ovhg' : 0,
3115 'scd3' : None,
3116 'suppl' : ('V',),
3117 'scd5' : None,
3118 'charac' : (3, -3, None, None, 'GGNNCC'),
3119 'ovhgseq' : '',
3120 }
3121 rest_dict['BmiI'] = _temp()
3122
3124 return {
3125 'compsite' : '(?P<BmrFI>CC.GG)|(?P<BmrFI_as>CC.GG)',
3126 'results' : None,
3127 'site' : 'CCNGG',
3128 'substrat' : 'DNA',
3129 'fst3' : -2,
3130 'fst5' : 2,
3131 'freq' : 256,
3132 'size' : 5,
3133 'opt_temp' : 37,
3134 'dna' : None,
3135 'inact_temp' : 65,
3136 'ovhg' : -1,
3137 'scd3' : None,
3138 'suppl' : ('V',),
3139 'scd5' : None,
3140 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCNGG'),
3141 'ovhgseq' : 'N',
3142 }
3143 rest_dict['BmrFI'] = _temp()
3144
3146 return {
3147 'compsite' : '(?P<BmrI>ACTGGG)|(?P<BmrI_as>CCCAGT)',
3148 'results' : None,
3149 'site' : 'ACTGGG',
3150 'substrat' : 'DNA',
3151 'fst3' : 4,
3152 'fst5' : 11,
3153 'freq' : 4096,
3154 'size' : 6,
3155 'opt_temp' : 37,
3156 'dna' : None,
3157 'inact_temp' : 65,
3158 'ovhg' : 1,
3159 'scd3' : None,
3160 'suppl' : ('N',),
3161 'scd5' : None,
3162 'charac' : (11, 4, None, None, 'ACTGGG'),
3163 'ovhgseq' : 'N',
3164 }
3165 rest_dict['BmrI'] = _temp()
3166
3168 return {
3169 'compsite' : '(?P<BmsI>GCATC)|(?P<BmsI_as>GATGC)',
3170 'results' : None,
3171 'site' : 'GCATC',
3172 'substrat' : 'DNA',
3173 'fst3' : 9,
3174 'fst5' : 10,
3175 'freq' : 1024,
3176 'size' : 5,
3177 'opt_temp' : 37,
3178 'dna' : None,
3179 'inact_temp' : 65,
3180 'ovhg' : -4,
3181 'scd3' : None,
3182 'suppl' : ('F',),
3183 'scd5' : None,
3184 'charac' : (10, 9, None, None, 'GCATC'),
3185 'ovhgseq' : 'NNNN',
3186 }
3187 rest_dict['BmsI'] = _temp()
3188
3190 return {
3191 'compsite' : '(?P<BmtI>GCTAGC)|(?P<BmtI_as>GCTAGC)',
3192 'results' : None,
3193 'site' : 'GCTAGC',
3194 'substrat' : 'DNA',
3195 'fst3' : -5,
3196 'fst5' : 5,
3197 'freq' : 4096,
3198 'size' : 6,
3199 'opt_temp' : 37,
3200 'dna' : None,
3201 'inact_temp' : 65,
3202 'ovhg' : 4,
3203 'scd3' : None,
3204 'suppl' : ('I', 'N', 'V'),
3205 'scd5' : None,
3206 'charac' : (5, -5, None, None, 'GCTAGC'),
3207 'ovhgseq' : 'CTAG',
3208 }
3209 rest_dict['BmtI'] = _temp()
3210
3212 return {
3213 'compsite' : '(?P<BmuI>ACTGGG)|(?P<BmuI_as>CCCAGT)',
3214 'results' : None,
3215 'site' : 'ACTGGG',
3216 'substrat' : 'DNA',
3217 'fst3' : 4,
3218 'fst5' : 11,
3219 'freq' : 4096,
3220 'size' : 6,
3221 'opt_temp' : 37,
3222 'dna' : None,
3223 'inact_temp' : 65,
3224 'ovhg' : 1,
3225 'scd3' : None,
3226 'suppl' : ('I',),
3227 'scd5' : None,
3228 'charac' : (11, 4, None, None, 'ACTGGG'),
3229 'ovhgseq' : 'N',
3230 }
3231 rest_dict['BmuI'] = _temp()
3232
3234 return {
3235 'compsite' : '(?P<BoxI>GAC....GTC)|(?P<BoxI_as>GAC....GTC)',
3236 'results' : None,
3237 'site' : 'GACNNNNGTC',
3238 'substrat' : 'DNA',
3239 'fst3' : -5,
3240 'fst5' : 5,
3241 'freq' : 4096,
3242 'size' : 10,
3243 'opt_temp' : 37,
3244 'dna' : None,
3245 'inact_temp' : 65,
3246 'ovhg' : 0,
3247 'scd3' : None,
3248 'suppl' : ('F',),
3249 'scd5' : None,
3250 'charac' : (5, -5, None, None, 'GACNNNNGTC'),
3251 'ovhgseq' : '',
3252 }
3253 rest_dict['BoxI'] = _temp()
3254
3256 return {
3257 'compsite' : '(?P<BpiI>GAAGAC)|(?P<BpiI_as>GTCTTC)',
3258 'results' : None,
3259 'site' : 'GAAGAC',
3260 'substrat' : 'DNA',
3261 'fst3' : 6,
3262 'fst5' : 8,
3263 'freq' : 4096,
3264 'size' : 6,
3265 'opt_temp' : 37,
3266 'dna' : None,
3267 'inact_temp' : 65,
3268 'ovhg' : -4,
3269 'scd3' : None,
3270 'suppl' : ('F',),
3271 'scd5' : None,
3272 'charac' : (8, 6, None, None, 'GAAGAC'),
3273 'ovhgseq' : 'NNNN',
3274 }
3275 rest_dict['BpiI'] = _temp()
3276
3278 return {
3279 'compsite' : '(?P<BplI>GAG.....CTC)|(?P<BplI_as>GAG.....CTC)',
3280 'results' : None,
3281 'site' : 'GAGNNNNNCTC',
3282 'substrat' : 'DNA',
3283 'fst3' : -24,
3284 'fst5' : -8,
3285 'freq' : 4096,
3286 'size' : 11,
3287 'opt_temp' : 37,
3288 'dna' : None,
3289 'inact_temp' : 65,
3290 'ovhg' : 5,
3291 'scd3' : 8,
3292 'suppl' : ('F',),
3293 'scd5' : 24,
3294 'charac' : (-8, -24, 24, 8, 'GAGNNNNNCTC'),
3295 'ovhgseq' : 'NNNNN',
3296 }
3297 rest_dict['BplI'] = _temp()
3298
3300 return {
3301 'compsite' : '(?P<BpmI>CTGGAG)|(?P<BpmI_as>CTCCAG)',
3302 'results' : None,
3303 'site' : 'CTGGAG',
3304 'substrat' : 'DNA',
3305 'fst3' : 14,
3306 'fst5' : 22,
3307 'freq' : 4096,
3308 'size' : 6,
3309 'opt_temp' : 37,
3310 'dna' : None,
3311 'inact_temp' : 65,
3312 'ovhg' : 2,
3313 'scd3' : None,
3314 'suppl' : ('I', 'N'),
3315 'scd5' : None,
3316 'charac' : (22, 14, None, None, 'CTGGAG'),
3317 'ovhgseq' : 'NN',
3318 }
3319 rest_dict['BpmI'] = _temp()
3320
3322 return {
3323 'compsite' : '(?P<Bpu10I>CCT.AGC)|(?P<Bpu10I_as>GCT.AGG)',
3324 'results' : None,
3325 'site' : 'CCTNAGC',
3326 'substrat' : 'DNA',
3327 'fst3' : -2,
3328 'fst5' : 2,
3329 'freq' : 4096,
3330 'size' : 7,
3331 'opt_temp' : 37,
3332 'dna' : None,
3333 'inact_temp' : 65,
3334 'ovhg' : -3,
3335 'scd3' : None,
3336 'suppl' : ('F', 'I', 'N', 'V'),
3337 'scd5' : None,
3338 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCTNAGC'),
3339 'ovhgseq' : 'TNA',
3340 }
3341 rest_dict['Bpu10I'] = _temp()
3342
3344 return {
3345 'compsite' : '(?P<Bpu1102I>GCT.AGC)|(?P<Bpu1102I_as>GCT.AGC)',
3346 'results' : None,
3347 'site' : 'GCTNAGC',
3348 'substrat' : 'DNA',
3349 'fst3' : -2,
3350 'fst5' : 2,
3351 'freq' : 4096,
3352 'size' : 7,
3353 'opt_temp' : 37,
3354 'dna' : None,
3355 'inact_temp' : 65,
3356 'ovhg' : -3,
3357 'scd3' : None,
3358 'suppl' : ('F', 'K'),
3359 'scd5' : None,
3360 'charac' : (2, -2, None, None, 'GCTNAGC'),
3361 'ovhgseq' : 'TNA',
3362 }
3363 rest_dict['Bpu1102I'] = _temp()
3364
3366 return {
3367 'compsite' : '(?P<Bpu14I>TTCGAA)|(?P<Bpu14I_as>TTCGAA)',
3368 'results' : None,
3369 'site' : 'TTCGAA',
3370 'substrat' : 'DNA',
3371 'fst3' : -2,
3372 'fst5' : 2,
3373 'freq' : 4096,
3374 'size' : 6,
3375 'opt_temp' : 37,
3376 'dna' : None,
3377 'inact_temp' : 65,
3378 'ovhg' : -2,
3379 'scd3' : None,
3380 'suppl' : ('I', 'V'),
3381 'scd5' : None,
3382 'charac' : (2, -2, None, None, 'TTCGAA'),
3383 'ovhgseq' : 'CG',
3384 }
3385 rest_dict['Bpu14I'] = _temp()
3386
3388 return {
3389 'compsite' : '(?P<BpuAI>GAAGAC)|(?P<BpuAI_as>GTCTTC)',
3390 'results' : None,
3391 'site' : 'GAAGAC',
3392 'substrat' : 'DNA',
3393 'fst3' : 6,
3394 'fst5' : 8,
3395 'freq' : 4096,
3396 'size' : 6,
3397 'opt_temp' : 37,
3398 'dna' : None,
3399 'inact_temp' : 65,
3400 'ovhg' : -4,
3401 'scd3' : None,
3402 'suppl' : ('M',),
3403 'scd5' : None,
3404 'charac' : (8, 6, None, None, 'GAAGAC'),
3405 'ovhgseq' : 'NNNN',
3406 }
3407 rest_dict['BpuAI'] = _temp()
3408
3410 return {
3411 'compsite' : '(?P<BpuEI>CTTGAG)|(?P<BpuEI_as>CTCAAG)',
3412 'results' : None,
3413 'site' : 'CTTGAG',
3414 'substrat' : 'DNA',
3415 'fst3' : 14,
3416 'fst5' : 22,
3417 'freq' : 4096,
3418 'size' : 6,
3419 'opt_temp' : 37,
3420 'dna' : None,
3421 'inact_temp' : 65,
3422 'ovhg' : 2,
3423 'scd3' : None,
3424 'suppl' : ('N',),
3425 'scd5' : None,
3426 'charac' : (22, 14, None, None, 'CTTGAG'),
3427 'ovhgseq' : 'NN',
3428 }
3429 rest_dict['BpuEI'] = _temp()
3430
3432 return {
3433 'compsite' : '(?P<BpuMI>CC[CG]GG)|(?P<BpuMI_as>CC[CG]GG)',
3434 'results' : None,
3435 'site' : 'CCSGG',
3436 'substrat' : 'DNA',
3437 'fst3' : -2,
3438 'fst5' : 2,
3439 'freq' : 512,
3440 'size' : 5,
3441 'opt_temp' : 37,
3442 'dna' : None,
3443 'inact_temp' : 65,
3444 'ovhg' : -1,
3445 'scd3' : None,
3446 'suppl' : ('V',),
3447 'scd5' : None,
3448 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCSGG'),
3449 'ovhgseq' : 'S',
3450 }
3451 rest_dict['BpuMI'] = _temp()
3452
3454 return {
3455 'compsite' : '(?P<BpvUI>CGATCG)|(?P<BpvUI_as>CGATCG)',
3456 'results' : None,
3457 'site' : 'CGATCG',
3458 'substrat' : 'DNA',
3459 'fst3' : -4,
3460 'fst5' : 4,
3461 'freq' : 4096,
3462 'size' : 6,
3463 'opt_temp' : 37,
3464 'dna' : None,
3465 'inact_temp' : 65,
3466 'ovhg' : 2,
3467 'scd3' : None,
3468 'suppl' : ('V',),
3469 'scd5' : None,
3470 'charac' : (4, -4, None, None, 'CGATCG'),
3471 'ovhgseq' : 'AT',
3472 }
3473 rest_dict['BpvUI'] = _temp()
3474
3476 return {
3477 'compsite' : '(?P<Bsa29I>ATCGAT)|(?P<Bsa29I_as>ATCGAT)',
3478 'results' : None,
3479 'site' : 'ATCGAT',
3480 'substrat' : 'DNA',
3481 'fst3' : -2,
3482 'fst5' : 2,
3483 'freq' : 4096,
3484 'size' : 6,
3485 'opt_temp' : 37,
3486 'dna' : None,
3487 'inact_temp' : 65,
3488 'ovhg' : -2,
3489 'scd3' : None,
3490 'suppl' : ('I',),
3491 'scd5' : None,
3492 'charac' : (2, -2, None, None, 'ATCGAT'),
3493 'ovhgseq' : 'CG',
3494 }
3495 rest_dict['Bsa29I'] = _temp()
3496
3498 return {
3499 'compsite' : '(?P<BsaAI>[CT]ACGT[AG])|(?P<BsaAI_as>[CT]ACGT[AG])',
3500 'results' : None,
3501 'site' : 'YACGTR',
3502 'substrat' : 'DNA',
3503 'fst3' : -3,
3504 'fst5' : 3,
3505 'freq' : 1024,
3506 'size' : 6,
3507 'opt_temp' : 37,
3508 'dna' : None,
3509 'inact_temp' : 65,
3510 'ovhg' : 0,
3511 'scd3' : None,
3512 'suppl' : ('N',),
3513 'scd5' : None,
3514 'charac' : (3, -3, None, None, 'YACGTR'),
3515 'ovhgseq' : '',
3516 }
3517 rest_dict['BsaAI'] = _temp()
3518
3520 return {
3521 'compsite' : '(?P<BsaBI>GAT....ATC)|(?P<BsaBI_as>GAT....ATC)',
3522 'results' : None,
3523 'site' : 'GATNNNNATC',
3524 'substrat' : 'DNA',
3525 'fst3' : -5,
3526 'fst5' : 5,
3527 'freq' : 4096,
3528 'size' : 10,
3529 'opt_temp' : 37,
3530 'dna' : None,
3531 'inact_temp' : 65,
3532 'ovhg' : 0,
3533 'scd3' : None,
3534 'suppl' : ('N',),
3535 'scd5' : None,
3536 'charac' : (5, -5, None, None, 'GATNNNNATC'),
3537 'ovhgseq' : '',
3538 }
3539 rest_dict['BsaBI'] = _temp()
3540
3542 return {
3543 'compsite' : '(?P<BsaHI>G[AG]CG[CT]C)|(?P<BsaHI_as>G[AG]CG[CT]C)',
3544 'results' : None,
3545 'site' : 'GRCGYC',
3546 'substrat' : 'DNA',
3547 'fst3' : -2,
3548 'fst5' : 2,
3549 'freq' : 1024,
3550 'size' : 6,
3551 'opt_temp' : 37,
3552 'dna' : None,
3553 'inact_temp' : 65,
3554 'ovhg' : -2,
3555 'scd3' : None,
3556 'suppl' : ('N',),
3557 'scd5' : None,
3558 'charac' : (2, -2, None, None, 'GRCGYC'),
3559 'ovhgseq' : 'CG',
3560 }
3561 rest_dict['BsaHI'] = _temp()
3562
3564 return {
3565 'compsite' : '(?P<BsaI>GGTCTC)|(?P<BsaI_as>GAGACC)',
3566 'results' : None,
3567 'site' : 'GGTCTC',
3568 'substrat' : 'DNA',
3569 'fst3' : 5,
3570 'fst5' : 7,
3571 'freq' : 4096,
3572 'size' : 6,
3573 'opt_temp' : 37,
3574 'dna' : None,
3575 'inact_temp' : 65,
3576 'ovhg' : -4,
3577 'scd3' : None,
3578 'suppl' : ('N',),
3579 'scd5' : None,
3580 'charac' : (7, 5, None, None, 'GGTCTC'),
3581 'ovhgseq' : 'NNNN',
3582 }
3583 rest_dict['BsaI'] = _temp()
3584
3586 return {
3587 'compsite' : '(?P<BsaJI>CC..GG)|(?P<BsaJI_as>CC..GG)',
3588 'results' : None,
3589 'site' : 'CCNNGG',
3590 'substrat' : 'DNA',
3591 'fst3' : -1,
3592 'fst5' : 1,
3593 'freq' : 256,
3594 'size' : 6,
3595 'opt_temp' : 37,
3596 'dna' : None,
3597 'inact_temp' : 65,
3598 'ovhg' : -4,
3599 'scd3' : None,
3600 'suppl' : ('N',),
3601 'scd5' : None,
3602 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCNNGG'),
3603 'ovhgseq' : 'CNNG',
3604 }
3605 rest_dict['BsaJI'] = _temp()
3606
3608 return {
3609 'compsite' : '(?P<BsaMI>GAATGC)|(?P<BsaMI_as>GCATTC)',
3610 'results' : None,
3611 'site' : 'GAATGC',
3612 'substrat' : 'DNA',
3613 'fst3' : -1,
3614 'fst5' : 7,
3615 'freq' : 4096,
3616 'size' : 6,
3617 'opt_temp' : 37,
3618 'dna' : None,
3619 'inact_temp' : 65,
3620 'ovhg' : 2,
3621 'scd3' : None,
3622 'suppl' : ('R',),
3623 'scd5' : None,
3624 'charac' : (7, -1, None, None, 'GAATGC'),
3625 'ovhgseq' : 'CN',
3626 }
3627 rest_dict['BsaMI'] = _temp()
3628
3630 return {
3631 'compsite' : '(?P<BsaWI>[AT]CCGG[AT])|(?P<BsaWI_as>[AT]CCGG[AT])',
3632 'results' : None,
3633 'site' : 'WCCGGW',
3634 'substrat' : 'DNA',
3635 'fst3' : -1,
3636 'fst5' : 1,
3637 'freq' : 1024,
3638 'size' : 6,
3639 'opt_temp' : 37,
3640 'dna' : None,
3641 'inact_temp' : 65,
3642 'ovhg' : -4,
3643 'scd3' : None,
3644 'suppl' : ('N',),
3645 'scd5' : None,
3646 'charac' : (1, -1, None, None, 'WCCGGW'),
3647 'ovhgseq' : 'CCGG',
3648 }
3649 rest_dict['BsaWI'] = _temp()
3650
3652 return {
3653 'compsite' : '(?P<BsaXI>AC.....CTCC)|(?P<BsaXI_as>GGAG.....GT)',
3654 'results' : None,
3655 'site' : 'ACNNNNNCTCC',
3656 'substrat' : 'DNA',
3657 'fst3' : -23,
3658 'fst5' : -9,
3659 'freq' : 4096,
3660 'size' : 11,
3661 'opt_temp' : 37,
3662 'dna' : None,
3663 'inact_temp' : 65,
3664 'ovhg' : 3,
3665 'scd3' : 7,
3666 'suppl' : ('N',),
3667 'scd5' : 21,
3668 'charac' : (-9, -23, 21, 7, 'ACNNNNNCTCC'),
3669 'ovhgseq' : 'NNN',
3670 }
3671 rest_dict['BsaXI'] = _temp()
3672
3674 return {
3675 'compsite' : '(?P<BsbI>CAACAC)|(?P<BsbI_as>GTGTTG)',
3676 'results' : None,
3677 'site' : 'CAACAC',
3678 'substrat' : 'DNA',
3679 'fst3' : 19,
3680 'fst5' : 27,
3681 'freq' : 4096,
3682 'size' : 6,
3683 'opt_temp' : 37,
3684 'dna' : None,
3685 'inact_temp' : 65,
3686 'ovhg' : 2,
3687 'scd3' : None,
3688 'suppl' : (),
3689 'scd5' : None,
3690 'charac' : (27, 19, None, None, 'CAACAC'),
3691 'ovhgseq' : 'NN',
3692 }
3693 rest_dict['BsbI'] = _temp()
3694
3696 return {
3697 'compsite' : '(?P<Bsc4I>CC.......GG)|(?P<Bsc4I_as>CC.......GG)',
3698 'results' : None,
3699 'site' : 'CCNNNNNNNGG',
3700 'substrat' : 'DNA',
3701 'fst3' : -7,
3702 'fst5' : 7,
3703 'freq' : 256,
3704 'size' : 11,
3705 'opt_temp' : 37,
3706 'dna' : None,
3707 'inact_temp' : 65,
3708 'ovhg' : 3,
3709 'scd3' : None,
3710 'suppl' : ('I',),
3711 'scd5' : None,
3712 'charac' : (7, -7, None, None, 'CCNNNNNNNGG'),
3713 'ovhgseq' : 'NNN',
3714 }
3715 rest_dict['Bsc4I'] = _temp()
3716
3718 return {
3719 'compsite' : '(?P<BscAI>GCATC)|(?P<BscAI_as>GATGC)',
3720 'results' : None,
3721 'site' : 'GCATC',
3722 'substrat' : 'DNA',
3723 'fst3' : 6,
3724 'fst5' : 9,
3725 'freq' : 1024,
3726 'size' : 5,
3727 'opt_temp' : 37,
3728 'dna' : None,
3729 'inact_temp' : 65,
3730 'ovhg' : -2,
3731 'scd3' : None,
3732 'suppl' : (),
3733 'scd5' : None,
3734 'charac' : (9, 6, None, None, 'GCATC'),
3735 'ovhgseq' : 'NN',
3736 }
3737 rest_dict['BscAI'] = _temp()
3738
3740 return {
3741 'compsite' : '(?P<BscGI>CCCGT)|(?P<BscGI_as>ACGGG)',
3742 'results' : None,
3743 'site' : 'CCCGT',
3744 'substrat' : 'DNA',
3745 'fst3' : None,
3746 'fst5' : None,
3747 'freq' : 1024,
3748 'size' : 5,
3749 'opt_temp' : 37,
3750 'dna' : None,
3751 'inact_temp' : 65,
3752 'ovhg' : None,
3753 'scd3' : None,
3754 'suppl' : (),
3755 'scd5' : None,
3756 'charac' : (None, None, None, None, 'CCCGT'),
3757 'ovhgseq' : None,
3758 }
3759 rest_dict['BscGI'] = _temp()
3760
3762 return {
3763 'compsite' : '(?P<Bse118I>[AG]CCGG[CT])|(?P<Bse118I_as>[AG]CCGG[CT])',
3764 'results' : None,
3765 'site' : 'RCCGGY',
3766 'substrat' : 'DNA',
3767 'fst3' : -1,
3768 'fst5' : 1,
3769 'freq' : 1024,
3770 'size' : 6,
3771 'opt_temp' : 37,
3772 'dna' : None,
3773 'inact_temp' : 65,
3774 'ovhg' : -4,
3775 'scd3' : None,
3776 'suppl' : ('I', 'V'),
3777 'scd5' : None,
3778 'charac' : (1, -1, None, None, 'RCCGGY'),
3779 'ovhgseq' : 'CCGG',
3780 }
3781 rest_dict['Bse118I'] = _temp()
3782
3784 return {
3785 'compsite' : '(?P<Bse1I>ACTGG)|(?P<Bse1I_as>CCAGT)',
3786 'results' : None,
3787 'site' : 'ACTGG',
3788 'substrat' : 'DNA',
3789 'fst3' : -1,
3790 'fst5' : 6,
3791 'freq' : 1024,
3792 'size' : 5,
3793 'opt_temp' : 37,
3794 'dna' : None,
3795 'inact_temp' : 65,
3796 'ovhg' : 2,
3797 'scd3' : None,
3798 'suppl' : ('I', 'V'),
3799 'scd5' : None,
3800 'charac' : (6, -1, None, None, 'ACTGG'),
3801 'ovhgseq' : 'GN',
3802 }
3803 rest_dict['Bse1I'] = _temp()
3804
3806 return {
3807 'compsite' : '(?P<Bse21I>CCT.AGG)|(?P<Bse21I_as>CCT.AGG)',
3808 'results' : None,
3809 'site' : 'CCTNAGG',
3810 'substrat' : 'DNA',
3811 'fst3' : -2,
3812 'fst5' : 2,
3813 'freq' : 4096,
3814 'size' : 7,
3815 'opt_temp' : 37,
3816 'dna' : None,
3817 'inact_temp' : 65,
3818 'ovhg' : -3,
3819 'scd3' : None,
3820 'suppl' : ('I', 'V'),
3821 'scd5' : None,
3822 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCTNAGG'),
3823 'ovhgseq' : 'TNA',
3824 }
3825 rest_dict['Bse21I'] = _temp()
3826
3828 return {
3829 'compsite' : '(?P<Bse3DI>GCAATG)|(?P<Bse3DI_as>CATTGC)',
3830 'results' : None,
3831 'site' : 'GCAATG',
3832 'substrat' : 'DNA',
3833 'fst3' : 0,
3834 'fst5' : 8,
3835 'freq' : 4096,
3836 'size' : 6,
3837 'opt_temp' : 37,
3838 'dna' : None,
3839 'inact_temp' : 65,
3840 'ovhg' : 2,
3841 'scd3' : None,
3842 'suppl' : ('I', 'V'),
3843 'scd5' : None,
3844 'charac' : (8, 0, None, None, 'GCAATG'),
3845 'ovhgseq' : 'NN',
3846 }
3847 rest_dict['Bse3DI'] = _temp()
3848
3850 return {
3851 'compsite' : '(?P<Bse8I>GAT....ATC)|(?P<Bse8I_as>GAT....ATC)',
3852 'results' : None,
3853 'site' : 'GATNNNNATC',
3854 'substrat' : 'DNA',
3855 'fst3' : -5,
3856 'fst5' : 5,
3857 'freq' : 4096,
3858 'size' : 10,
3859 'opt_temp' : 37,
3860 'dna' : None,
3861 'inact_temp' : 65,
3862 'ovhg' : 0,
3863 'scd3' : None,
3864 'suppl' : ('I', 'V'),
3865 'scd5' : None,
3866 'charac' : (5, -5, None, None, 'GATNNNNATC'),
3867 'ovhgseq' : '',
3868 }
3869 rest_dict['Bse8I'] = _temp()
3870
3872 return {
3873 'compsite' : '(?P<BseAI>TCCGGA)|(?P<BseAI_as>TCCGGA)',
3874 'results' : None,
3875 'site' : 'TCCGGA',
3876 'substrat' : 'DNA',
3877 'fst3' : -1,
3878 'fst5' : 1,
3879 'freq' : 4096,
3880 'size' : 6,
3881 'opt_temp' : 37,
3882 'dna' : None,
3883 'inact_temp' : 65,
3884 'ovhg' : -4,
3885 'scd3' : None,
3886 'suppl' : ('C', 'M'),
3887 'scd5' : None,
3888 'charac' : (1, -1, None, None, 'TCCGGA'),
3889 'ovhgseq' : 'CCGG',
3890 }
3891 rest_dict['BseAI'] = _temp()
3892
3894 return {
3895 'compsite' : '(?P<BseBI>CC[AT]GG)|(?P<BseBI_as>CC[AT]GG)',
3896 'results' : None,
3897 'site' : 'CCWGG',
3898 'substrat' : 'DNA',
3899 'fst3' : -2,
3900 'fst5' : 2,
3901 'freq' : 512,
3902 'size' : 5,
3903 'opt_temp' : 37,
3904 'dna' : None,
3905 'inact_temp' : 65,
3906 'ovhg' : -1,
3907 'scd3' : None,
3908 'suppl' : ('C',),
3909 'scd5' : None,
3910 'charac' : (2, -2, None, None, 'CCWGG'),
3911 'ovhgseq' : 'W',
3912 }
3913 rest_dict['BseBI'] = _temp()
3914
3916 return {
3917 'compsite' : '(?P<BseCI>ATCGAT)|(?P<BseCI_as>ATCGAT)',
3918 'results' : None,
3919 'site' : 'ATCGAT',
3920 'substrat' : 'DNA',
3921 'fst3' : -2,
3922 'fst5' : 2,
3923 'freq' : 4096,
3924 'size' : 6,
3925 'opt_temp' : 37,
3926 'dna' : None,
3927 'inact_temp' : 65,
3928 'ovhg' : -2,
3929 'scd3' : None,
3930 'suppl' : ('C',),
3931 'scd5' : None,
3932 'charac' : (2, -2, None, None, 'ATCGAT'),
3933 'ovhgseq' : 'CG',
3934 }
3935 rest_dict['BseCI'] = _temp()
3936
3938 return {
3939 'compsite' : '(?P<BseDI>CC..GG)|(?P<BseDI_as>CC..GG)',
3940 'results' : None,
3941 'site' : 'CCNNGG',
3942 'substrat' : 'DNA',
3943 'fst3' : -1,
3944 'fst5' : 1,
3945 'freq' : 256,
3946 'size' : 6,
3947 'opt_temp' : 37,
3948 'dna' : None,
3949 'inact_temp' : 65,
3950 'ovhg' : -4,
3951 'scd3' : None,
3952 'suppl' : ('F',),
3953 'scd5' : None,
3954 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCNNGG'),
3955 'ovhgseq' : 'CNNG',
3956 }
3957 rest_dict['BseDI'] = _temp()
3958
3960 return {
3961 'compsite' : '(?P<BseGI>GGATG)|(?P<BseGI_as>CATCC)',
3962 'results' : None,
3963 'site' : 'GGATG',
3964 'substrat' : 'DNA',
3965 'fst3' : 0,
3966 'fst5' : 7,
3967 'freq' : 1024,
3968 'size' : 5,
3969 'opt_temp' : 37,
3970 'dna' : None,
3971 'inact_temp' : 65,
3972 'ovhg' : 2,
3973 'scd3' : None,
3974 'suppl' : ('F',),
3975 'scd5' : None,
3976 'charac' : (7, 0, None, None, 'GGATG'),
3977 'ovhgseq' : 'NN',
3978 }
3979 rest_dict['BseGI'] = _temp()
3980
3982 return {
3983 'compsite' : '(?P<BseJI>GAT....ATC)|(?P<BseJI_as>GAT....ATC)',
3984 'results' : None,
3985 'site' : 'GATNNNNATC',
3986 'substrat' : 'DNA',
3987 'fst3' : -5,
3988 'fst5' : 5,
3989 'freq' : 4096,
3990 'size' : 10,
3991 'opt_temp' : 37,
3992 'dna' : None,
3993 'inact_temp' : 65,
3994 'ovhg' : 0,
3995 'scd3' : None,
3996 'suppl' : ('F',),
3997 'scd5' : None,
3998 'charac' : (5, -5, None, None, 'GATNNNNATC'),
3999 'ovhgseq' : '',
4000 }
4001 rest_dict['BseJI'] = _temp()
4002
4004 return {
4005 'compsite' : '(?P<BseLI>CC.......GG)|(?P<BseLI_as>CC.......GG)',
4006 'results' : None,
4007 'site' : 'CCNNNNNNNGG',
4008 'substrat' : 'DNA',
4009 'fst3' : -7,
4010 'fst5' : 7,
4011 'freq' : 256,
4012 'size' : 11,
4013 'opt_temp' : 37,
4014 'dna' : None,
4015 'inact_temp' : 65,
4016 'ovhg' : 3,
4017 'scd3' : None,
4018 'suppl' : ('F',),
4019 'scd5' : None,
4020 'charac' : (7, -7, None, None, 'CCNNNNNNNGG'),
4021 'ovhgseq' : 'NNN',
4022 }
4023 rest_dict['BseLI'] = _temp()
4024
4026 return {
4027 'compsite' : '(?P<BseMI>GCAATG)|(?P<BseMI_as>CATTGC)',
4028 'results' : None,
4029 'site' : 'GCAATG',
4030 'substrat' : 'DNA',
4031 'fst3' : 0,
4032 'fst5' : 8,
4033 'freq' : 4096,
4034 'size' : 6,
4035 'opt_temp' : 37,
4036 'dna' : None,
4037 'inact_temp' : 65,
4038 'ovhg' : 2,
4039 'scd3' : None,
4040 'suppl' : ('F',),
4041 'scd5' : None,
4042 'charac' : (8, 0, None, None, 'GCAATG'),
4043 'ovhgseq' : 'NN',
4044 }
4045 rest_dict['BseMI'] = _temp()
4046
4048 return {
4049 'compsite' : '(?P<BseMII>CTCAG)|(?P<BseMII_as>CTGAG)',
4050 'results' : None,
4051 'site' : 'CTCAG',
4052 'substrat' : 'DNA',
4053 'fst3' : 8,
4054 'fst5' : 15,
4055 'freq' : 1024,
4056 'size' : 5,
4057 'opt_temp' : 37,
4058 'dna' : None,
4059 'inact_temp' : 65,
4060 'ovhg' : 2,
4061 'scd3' : None,
4062 'suppl' : ('F',),
4063 'scd5' : None,
4064 'charac' : (15, 8, None, None, 'CTCAG'),
4065 'ovhgseq' : 'NN',
4066 }
4067 rest_dict['BseMII'] = _temp()
4068
4070 return {
4071 'compsite' : '(?P<BseNI>ACTGG)|(?P<BseNI_as>CCAGT)',
4072 'results' : None,
4073 'site' : 'ACTGG',
4074 'substrat' : 'DNA',
4075 'fst3' : -1,
4076 'fst5' : 6,
4077 'freq' : 1024,
4078 'size' : 5,
4079 'opt_temp' : 37,
4080 'dna' : None,
4081 'inact_temp' : 65,
4082 'ovhg' : 2,
4083 'scd3' : None,
4084 'suppl' : ('F',),
4085 'scd5' : None,
4086 'charac' : (6, -1, None, None, 'ACTGG'),
4087 'ovhgseq' : 'GN',
4088 }
4089 rest_dict['BseNI'] = _temp()
4090
4092 return {
4093 'compsite' : '(?P<BsePI>GCGCGC)|(?P<BsePI_as>GCGCGC)',
4094 'results' : None,
4095 'site' : 'GCGCGC',
4096 'substrat' : 'DNA',
4097 'fst3' : -1,
4098 'fst5' : 1,
4099 'freq' : 4096,
4100 'size' : 6,
4101 'opt_temp' : 37,
4102 'dna' : None,
4103 'inact_temp' : 65,
4104 'ovhg' : -4,
4105 'scd3' : None,
4106 'suppl' : ('I', 'V'),
4107 'scd5' : None,
4108 'charac' : (1, -1, None, None, 'GCGCGC'),
4109 'ovhgseq' : 'CGCG',
4110 }
4111 rest_dict['BsePI'] = _temp()
4112
4114 return {
4115 'compsite' : '(?P<BseRI>GAGGAG)|(?P<BseRI_as>CTCCTC)',
4116 'results' : None,
4117 'site' : 'GAGGAG',
4118 'substrat' : 'DNA',
4119 'fst3' : 8,
4120 'fst5' : 16,
4121 'freq' : 4096,
4122 'size' : 6,
4123 'opt_temp' : 37,
4124 'dna' : None,
4125 'inact_temp' : 65,
4126 'ovhg' : 2,
4127 'scd3' : None,
4128 'suppl' : ('N',),
4129 'scd5' : None,
4130 'charac' : (16, 8, None, None, 'GAGGAG'),
4131 'ovhgseq' : 'NN',
4132 }
4133 rest_dict['BseRI'] = _temp()
4134
4136 return {
4137 'compsite' : '(?P<BseSI>G[GT]GC[AC]C)|(?P<BseSI_as>G[GT]GC[AC]C)',
4138 'results' : None,
4139 'site' : 'GKGCMC',
4140 'substrat' : 'DNA',
4141 'fst3' : -5,
4142 'fst5' : 5,
4143 'freq' : 1024,
4144 'size' : 6,
4145 'opt_temp' : 37,
4146 'dna' : None,
4147 'inact_temp' : 65,
4148 'ovhg' : 4,
4149 'scd3' : None,
4150 'suppl' : ('F',),
4151 'scd5' : None,
4152 'charac' : (5, -5, None, None, 'GKGCMC'),
4153 'ovhgseq' : 'KGCM',
4154 }
4155 rest_dict['BseSI'] = _temp()
4156
4158 return {
4159 'compsite' : '(?P<BseX3I>CGGCCG)|(?P<BseX3I_as>CGGCCG)',
4160 'results' : None,
4161 'site' : 'CGGCCG',
4162 'substrat' : 'DNA',
4163 'fst3' : -1,
4164 'fst5' : 1,
4165 'freq' : 4096,
4166 'size' : 6,
4167 'opt_temp' : 37,
4168 'dna' : None,
4169 'inact_temp' : 65,
4170 'ovhg' : -4,
4171 'scd3' : None,
4172 'suppl' : ('I', 'V'),
4173 'scd5' : None,
4174 'charac' : (1, -1, None, None, 'CGGCCG'),
4175 'ovhgseq' : 'GGCC',
4176 }
4177 rest_dict['BseX3I'] = _temp()
4178
4180 return {
4181 'compsite' : '(?P<BseXI>GCAGC)|(?P<BseXI_as>GCTGC)',
4182 'results' : None,
4183 'site' : 'GCAGC',
4184 'substrat' : 'DNA',
4185 'fst3' : 12,
4186 'fst5' : 13,
4187 'freq' : 1024,
4188 'size' : 5,
4189 'opt_temp' : 37,
4190 'dna' : None,
4191 'inact_temp' : 65,
4192 'ovhg' : -4,
4193 'scd3' : None,
4194 'suppl' : ('F',),
4195 'scd5' : None,
4196 'charac' : (13, 12, None, None, 'GCAGC'),
4197 'ovhgseq' : 'NNNN',
4198 }
4199 rest_dict['BseXI'] = _temp()
4200
4202 return {
4203 'compsite' : '(?P<BseYI>CCCAGC)|(?P<BseYI_as>GCTGGG)',
4204 'results' : None,
4205 'site' : 'CCCAGC',
4206 'substrat' : 'DNA',
4207 'fst3' : -1,
4208 'fst5' : 1,
4209 'freq' : 4096,
4210 'size' : 6,
4211 'opt_temp' : 37,
4212 'dna' : None,
4213 'inact_temp' : 65,
4214 'ovhg' : -4,
4215 'scd3' : None,
4216 'suppl' : ('N',),
4217 'scd5' : None,
4218 'charac' : (1, -1, None, None, 'CCCAGC'),
4219 'ovhgseq' : 'CCAG',
4220 }
4221 rest_dict['BseYI'] = _temp()
4222
4224 return {
4225 'compsite' : '(?P<BsgI>GTGCAG)|(?P<BsgI_as>CTGCAC)',
4226 'results' : None,
4227 'site' : 'GTGCAG',
4228 'substrat' : 'DNA',
4229 'fst3' : 14,
4230 'fst5' : 22,
4231 'freq' : 4096,
4232 'size' : 6,
4233 'opt_temp' : 37,
4234 'dna' : None,
4235 'inact_temp' : 65,
4236 'ovhg' : 2,
4237 'scd3' : None,
4238 'suppl' : ('N',),
4239 'scd5' : None,
4240 'charac' : (22, 14, None, None, 'GTGCAG'),
4241 'ovhgseq' : 'NN',
4242 }
4243 rest_dict['BsgI'] = _temp()
4244
4246 return {
4247 'compsite' : '(?P<Bsh1236I>CGCG)|(?P<Bsh1236I_as>CGCG)',
4248 'results' : None,
4249 'site' : 'CGCG',
4250 'substrat' : 'DNA',
4251 'fst3' : -2,
4252 'fst5' : 2,
4253 'freq' : 256,
4254 'size' : 4,
4255 'opt_temp' : 37,
4256 'dna' : None,
4257 'inact_temp' : 65,
4258 'ovhg' : 0,
4259 'scd3' : None,
4260 'suppl' : ('F',),
4261 'scd5' : None,
4262 'charac' : (2, -2, None, None, 'CGCG'),
4263 'ovhgseq' : '',
4264 }
4265 rest_dict['Bsh1236I'] = _temp()
4266
4268 return {
4269 'compsite' : '(?P<Bsh1285I>CG[AG][CT]CG)|(?P<Bsh1285I_as>CG[AG][CT]CG)',
4270 'results' : None,
4271 'site' : 'CGRYCG',
4272 'substrat' : 'DNA',
4273 'fst3' : -4,
4274 'fst5' : 4,
4275 'freq' : 1024,
4276 'size' : 6,
4277 'opt_temp' : 37,
4278 'dna' : None,
4279 'inact_temp' : 65,
4280 'ovhg' : 2,
4281 'scd3' : None,
4282 'suppl' : ('F',),
4283 'scd5' : None,
4284 'charac' : (4, -4, None, None, 'CGRYCG'),
4285 'ovhgseq' : 'RY',
4286 }
4287 rest_dict['Bsh1285I'] = _temp()
4288
4290 return {
4291 'compsite' : '(?P<BshFI>GGCC)|(?P<BshFI_as>GGCC)',
4292 'results' : None,
4293 'site' : 'GGCC',
4294 'substrat' : 'DNA',
4295 'fst3' : -2,
4296 'fst5' : 2,
4297 'freq' : 256,
4298 'size' : 4,
4299 'opt_temp' : 37,
4300 'dna' : None,
4301 'inact_temp' : 65,
4302 'ovhg' : 0,
4303 'scd3' : None,
4304 'suppl' : ('C',),
4305 'scd5' : None,
4306 'charac' : (2, -2, None, None, 'GGCC'),
4307 'ovhgseq' : '',
4308 }
4309 rest_dict['BshFI'] = _temp()
4310
4312 return {
4313 'compsite' : '(?P<BshNI>GG[CT][AG]CC)|(?P<BshNI_as>GG[CT][AG]CC)',
4314 'results' : None,
4315 'site' : 'GGYRCC',
4316 'substrat' : 'DNA',
4317 'fst3' : -1,
4318 'fst5' : 1,
4319 'freq' : 1024,
4320 'size' : 6,
4321 'opt_temp' : 37,
4322 'dna' : None,
4323 'inact_temp' : 65,
4324 'ovhg' : -4,
4325 'scd3' : None,
4326 'suppl' : ('F',),
4327 'scd5' : None,
4328 'charac' : (1, -1, None, None, 'GGYRCC'),
4329 'ovhgseq' : 'GYRC',
4330 }
4331 rest_dict['BshNI'] = _temp()
4332
4334 return {
4335 'compsite' : '(?P<BshTI>ACCGGT)|(?P<BshTI_as>ACCGGT)',
4336 'results' : None,
4337 'site' : 'ACCGGT',
4338 'substrat' : 'DNA',
4339 'fst3' : -1,
4340 'fst5' : 1,
4341 'freq' : 4096,
4342 'size' : 6,
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4346 'ovhg' : -4,
4347 'scd3' : None,
4348 'suppl' : ('F',),
4349 'scd5' : None,
4350 'charac' : (1, -1, None, None, 'ACCGGT'),
4351 'ovhgseq' : 'CCGG',
4352 }
4353 rest_dict['BshTI'] = _temp()
4354
4356 return {
4357 'compsite' : '(?P<BshVI>ATCGAT)|(?P<BshVI_as>ATCGAT)',
4358 'results' : None,
4359 'site' : 'ATCGAT',
4360 'substrat' : 'DNA',
4361 'fst3' : -2,
4362 'fst5' : 2,
4363 'freq' : 4096,
4364 'size' : 6,
4365 'opt_temp' : 37,
4366 'dna' : None,
4367 'inact_temp' : 65,
4368 'ovhg' : -2,
4369 'scd3' : None,
4370 'suppl' : ('V',),
4371 'scd5' : None,
4372 'charac' : (2, -2, None, None, 'ATCGAT'),
4373 'ovhgseq' : 'CG',